New User Special Price Expires in

Let's log you in.

Sign in with Facebook


Don't have a StudySoup account? Create one here!


Create a StudySoup account

Be part of our community, it's free to join!

Sign up with Facebook


Create your account
By creating an account you agree to StudySoup's terms and conditions and privacy policy

Already have a StudySoup account? Login here

BIO 1144 - Exam 1 Notes

by: tabby byars

BIO 1144 - Exam 1 Notes Bio 1144

tabby byars
GPA 3.54

Preview These Notes for FREE

Get a free preview of these Notes, just enter your email below.

Unlock Preview
Unlock Preview

Preview these materials now for free

Why put in your email? Get access to more of this material and other relevant free materials for your school

View Preview

About this Document

These notes cover what are going to be on the first exam.
Biology II
Thomas Holder
biology ii
75 ?




Popular in Biology II

Popular in Biology

This 14 page Bundle was uploaded by tabby byars on Sunday January 31, 2016. The Bundle belongs to Bio 1144 at Mississippi State University taught by Thomas Holder in Spring 2015. Since its upload, it has received 45 views. For similar materials see Biology II in Biology at Mississippi State University.


Reviews for BIO 1144 - Exam 1 Notes


Report this Material


What is Karma?


Karma is the currency of StudySoup.

You can buy or earn more Karma at anytime and redeem it for class notes, study guides, flashcards, and more!

Date Created: 01/31/16
BIOLOGY II: NOTES FOR EXAM 1 Chapter 26 Taxonomy of Systematics  Taxonomy – the study of classifying and grouping organisms o Based on hierarchy groups (taxon) o Carolus Linnaeus, Swedish naturalist 1754, put plants and organisms in  groups by how similar they were. He created the binomial system of  nomenclature ­ 2 worded scientific name to describe an organism o Taxonomy is an “artificial” system  5 kingdom concept 1. Monera – prokaryotic cells (lack nucleus and lack membrane bound  structure) 2. Protista – eukaryotic cells (nucleus and have membrane bound structure) 3. Fungi – eukaryotic cells (nucleus and have membrane bound structure) 4. Plantae – eukaryotic cells (nucleus and have membrane bound structure) 5. Animalia – eukaryotic cells (nucleus and have membrane bound structure)  Taxonomy Hierarchy of the Gray Wolf o Kingdom Animalia o Phylum Chordata o Class Mammalia o Order Carnivora o Family Canidae o Genus  o Species Canus lupis  Systematics – biological diversity in evolutionary relationships o Molecular genetics and morphology  o Phylogenetic trees o Clade – a group of similar species on phylogenic trees C A A D B E Chapter 27 Prokaryotic and Eukaryotic Diversity Kingdom Monera  2 domains (archaea & bacteria)  Prokaryotic – lack nucleus and membrane bound structure  Lack sexual reproduction  Most abundant group  Fossils from 3.5 billion years ago  2 Domains of Monera: o Archaea  “Almost” nucleus   Similar cytoplasm of eukaryotes   Specialized membranes, but not membrane bound structures  Found in harsh conditions o Bacteria – “pro” and “cyano”  “Probacteria” – “true bacteria”  “Cyanobacteria” – “blue greens”  Produce food by capturing sunlight   Transform nitrogen into something useful *Everything else we study is eukaryotic.  Eukaryotic Cells o Have a nucleus o Have “compartments” or membrane bound structures o Creates an “internal membrane system” o More efficient and precise than prokaryotes  Chapter 28 Kingdom Protista  Earliest eukaryotes  Most live in moist environments and are microscopic  DNA – many separate groups within Protista   3 groups of Protista o Algae  Plant like because they capture sunlight and make their own food  (photosynthesis)  Autotrophic – “self feeding”  10 groups of algae  Some do ingest food  Unicellular to multicellular o Protozoans  “Animal like”  Heterotrophic – “ingest feeding:  Unicellular to multicellular o Fungi like Protists  “Fungi like”  Saprotrophic – “absorb feeding” (have no mouth with which to eat)  Multicellular   Movement of Protists o Flagella – swimming with tail­like structures o Cilia – tiny hairs on outside of the body that slowly mores protest o Pseudopodia – false feet – extension of the cytoplasm, usually moving  downhill  o Gliding – glides along a soft surface Kingdom Fungi  Largest living organisms in this kingdom  Most fungus are found in the soil or in other material  “Conspicuous portion” (part that you see) – mushroom or mold or yeast  “Nature’s recyclers” because they break down and return to the earth  Heterotrophic/saprotrophic  Body of the fungus is called the mycelium –composed of filaments (hyphae)  “Fruiting bodies” represent reproductive structures, the parts we can see coming  out of the ground  Spores – reproductive cells  Rhizomorphs – water transporting filaments  Cell wall – major component is chitin (hardening protein) to make the wall  tougher Chapters 29 & 30 Kingdom Plantae  Over 300,000 species  Multicellular & eukaryotic  Most are autotrophic ‘ “self feeding” (photosynthesis)  Mostly terrestrial – grow out of the soil  Starch – food storage compound  Photosynthetic pigments – chlorophyll a & b, b­carotene; primary photosynthetic  pigment is chlorophyll a   Cell wall – cellulose (major component, internal support)  3 characteristics – plant kingdom, land plants o Green algae is ancestor o Fossils from 400 million years before present o Life on land – must get water from soil (roots) Roots    10 major groups of plants 1) Phylum hepatophyta (liverworts) 6500 species 2) Phylum anthocertophyta (hornworts) 100 species 3) Phylum bryophyte (mosses) 12,000 species i. Grouped together as “bryophyte” 4) Phylum lycopodiophyta (lycophytes) 1000 species 5) Phylum pteridophyta (ferns & allies) 12,000 species i. Grouped together as “pteridophytes” 6) Phylum cycadophyta (cycods) 300 species 7) Phylum ginkgophyta (ginkgos) 1 species 8) Phylum gnetiphyta (gnetophytes) 300 species 9) Phylum coniferophyta  (cone­bearing trees) 500 species i. Grouped together as “gymnosperms” ­ naked seeds” 10)Phylum anthophyta (flowering/fruiting plants) 300,000 species i. “Angiosperms” = enclosed seeds (within a fruit)  Bryophytes – reproduce by spores, not seeds (can dry out easily) so they live in  areas with high amount of moisture o Non vascular – lack conducting tissues o Smallest plants because they don’t have vascular tissue o Require external water for reproduction  Pteridophytes – extensive fossil record  o Small  o Reproduce by spores, not seeds o Vascular tissue (conducting)  Xylem – conduct water & minerals  Phloem – conduct food  “True” roots, stems, and leaves  Gymnosperms – cone­bearing trees (mostly) o Oldest living organism – bristlecone pine o Biggest living organism – giant sequoia o Tallest living organism – redwood o Vascular – xylem & phloem tissues o “Naked seeds”  Advanced character   Inside the seed (exposed): embryo, stored food, protective covering (integument)  Seed has “survival value” o Does not require external water for reproduction  Pollen tube delivers sperm to egg location  Angiosperms – “enclosed seeds” within a fruit/vessel o Vascular tissues – more advanced, most complex  Conduct food & water even better o Seed – embryo, stored food, protective coverings (2 integuments)  2 integuments & enclosed seeds within a fruit provide an even  better “survival value” o Flowers – attract pollinators o Fruits – enclose/protect the seed & assist with seed dispersal o Over 300,000 species  o Does not require external water for reproduction  Pollen tube delivers sperm to the egg location Kingdom Animalia  1­3 million species (half are insects)  All came from one single ancestor – flagellated protest  35 animal phylum  More genetic similarity within animal genomes than other kingdoms   Characteristics  Multicellular  Lack cell walls  Sexual reproduction – mobile, smaller sperm, & larger egg  HOX genes  ­ determine the body axis during development Nervous tissue Cell junctions – anchoring, gap, & tight Proteins ­ binding cells Classification/systematics Systematics: molecular genetics; classification: development (embryonic),  morphology Body plans: 4  Body symmetry  Number of tissue layers  Presence/absence of a “true” body cavity  Patterns of embryonic development  Metazoans multicellularity + animal  Parazoa (sponges) simple multicellular, eumetazoa (all others) true multicellular  4 Body Plans of Animals 1. Body symmetry – equal sides, proportions of the body  Phylum porifera (sponges) lack symmetry  Eumetazoa have radial symmetry: only one plain passing thru the  central axis produces equal images  Eumetazoa exhibit bilateral symmetry – only one line or cut  produces mirror images 2. Tissue layers – the number of tissue present  Tissue ­ aggregation of functionally similar cells into a larger unit, higher the number the more complex the organisms will be  o Metazoa (phylum porifera, sponges) – Parazoa  don’t have organs or tissues, Eumetazoa have one  or more tissue types or organs  Animals that exhibit radial symmetry are diploblastic – 2  embryonic germ/tissue layers, *endoderm *ectoderm  Animals that exhibit bilateral symmetry are triploblastic – 3  embryonic germ/tissue layers, *endoderm *ectoderm *mesoderm o Tissue layers develop during early development  period – gastrulation 3. Body cavity – ONLY bilateral symmetrical animals   Coelom – a fluid filled body cavity in animals o Advanced animals have a “true coelom” meaning  the body cavity is completely lined with mesoderm or mesoderm derived tissues  Acoelomate – “without coelom” no body cavity, not completely  surrounded by mesoderm or mesoderm derived tissue Ex. – flatworms (phylum Platyhelminthes) dome  shape with flat bottom  Pseudocoelomate – “false coelom” – body cavity is present and  well developed, but not completely lined with mesoderm or  mesoderm derived tissue o Ex. Roundworm (phylum nematoda)  Eucoelomate – “true coelom” true body cavity and completely  lined with mesoderm or mesoderm derived tissue o Advanced metazoan  Ex. Earthworm (phylum annelid) 4. Embryonic development  Cleavage – cells get smaller and smaller  2 mechanisms ­ *protostomes *deuterostomes o Proto – first, deutero – secondary o Protostomes – 1  opening (blastopore) that  develops that becomes the mouth  Phylum Mollusca, annellida,  arthropoda o Deuterostomes – 2  opening (blastopore) that  becomes the mouth, delevops into the anus   Phylum Echinodermata, chordata  Other methods used to classift animals  Skeletons are used to classify animals o Exoskeleton – most invertebrates o Endoskeleton – provide internal development,  echinoderms, and vertebrates. Constant growth  within the body without loss of protection  Notochord – phylum chordate  Metamerism – (segmentation) repition of body parts  Cephalization – localization of sensory struds “brain” “head end” Molecular Views of Animal Diversity  New techniques that look at *DNA, *ribosomal RNA, and *mitochondrial DNA o Advantages – can be tested, can test and document how closely organisms are  related.  Similarities between traditional and molecular phylogeny  o Metazoan share common ancestor – protists o True difference between parazoa and eumetazoa (sponges and the rest of  them) o True difference between radial and bilateral symmetry o Echinodermata and chordate are closely related  Differences between these 2 methods o Protostomes – split into 2 clades (lines) based upon the genes o Body cavity – may not be a great character splitting groups Chapters 32 & 33 Invertebrates  Fossils   “Without backbone”  95% of animals species Phylum Porifera (sponges)  Lack tissues or organs  Multicellular  Different cell types with different functions  “Pores” – filter water and food  Reproduction ­ Hermaphroditism ­ produced both eggs and sperms o Some sexual reproduction o Some asexual reproduction Phylum Cnidaria & Phylum Ctenophora  Cnidaria – jellyfish, coral, and sea anemones, 9000 species  Ctenophera – comb jellies, 100 species Both diploblastic (2 germ layers) *endoderm *ectoderm, not very complex  Mostly marine  Mesoglea – gelatinous coating on the outside of the animal’s body provides with  protection, probably foul tasting  Lack brain, but have a Nerve net – interconnected nerve cells  Exhibit only one opening    Gastro vascular cavity – not mouth or anus Protostomes Phylum Platyhelminthes (flatworms, flukes, tapeworms) Many parasites 20,000 species Triploblastic (3 germ layers) *endoderm *ectoderm *mesoderm Protostomes Simple but developed organs and organ systems  Enhanced nerve net ­ 2 cerebral ganglia – mass of nerve tissue (not brain) One opening and a gastro vascular cavity Reproduction ­ sexual (hermaphrodites) and asexual (split) Phylum Rotifer – rotifers ( Spin in circles as they swim, move fairly quickly    Corona ­ crown  Mostly freshwater Very simple brain Pseudocoelom 2000 species Alimentary canal 0 digestive tube (mouth to anus) Triploblastic – advanced group of protostomes Reproduction ­ asexual and sexual (parthenogenesis) – egg develops without  fertilization from the sperm Phylum Mollusca (snails, slugs, oysters, squid, octopus) 106000 species Protostomes Eucoelomate Mostly have a 3 “part” body  Foot, visceral mass – where the internal organs are, mantle – thin fleshy layer inside the shell if a shell is present Reproduction ­ mostly sexual (eggs/sperm released)   Terrestrial (land) male transfers the sperm directly to the female Phylum Annelida  Segmented – ringed worms Enhanced digestive and nervous systems Reproduction ­ asexual and sexual (hermaphrodites) Protostomes Phylum Nematode (roundworms) Primarily buried in soil 20000 species Pseudocoelomate    Cuticle – rubber coating they shed from time to time in order to grow, can be  protection  Complete digestive tract  Protostomes  Reproduction – primarily sexual  Phylum arthropoda (insects, spiders, crustaceans)  1.75 million to 2 million species  Segmented appendages  Exoskeleton – skeleton on the outside  Hardened cuticle – protein and chitin (hardening protein) reason why you have  to have a tool to crack crab legs  Can shed the skin (ecdysis)  Protostomes  Enhanced brain and nervous system and a complex digestive system  Social insects have the most complex nervous system in all non­vertebrate  animals  Eucoelomate Phylum Echinodermata (sea stars, urchins, sea cucumbers)  Deuterostomes ­ first opening becomes anus, second becomes mouth  7500 species  No brain, simple nervous system  Reproduction mostly by sexual means  Autonomy – the breaking off of body parts  Endoskeleton ­  series of plates Phylum Chordate  Deuterostomes  Endoskeleton  Few invertebrates, most are vertebrate animals  4 critical innovations of chordate body design (found at some point of  development) 1. Notochord – skeletal support (dorsal axis), replaced by jointed backbone  (vertebral column). Remnants o notochord in discs because vertebrae 2. Dorsal hollow nerve cord – expanded at anterior end = brain. Enclosed,  supported, and protected by vertebral column and/or notochord  3. Pharyngeal slits – (pharynx­ back portion of the mouth cavity) Water enters  mouth and out the slits (gills­ no use on land). 4. Postanal tail –  a. Only a few fishes actually exhibit all 4 of these developments b. Humans – notochord ­> replaced by series of bony elements  (vertebra) with discs between each vertebrae so bone isn’t rubbing  against bone. Nerve chord ­> hollow dorsal (spinal cord & brain)  *largest brain capacity. Pharyngeal slits and postanal tail ­> only  found in embryonic development. 1 vertebrae retained as tailbone  (coccyx). 1 pharyngeal is slit retained as Eustachian tubes pair. Subphylum Urochordata  Tunicates  3000 species  Marine  Invertebrates  Filter feeders  Looks like a vase  Has pharyngeal slits and dorsal nerve cord  Ex. Larvae – gill slits, tail, notochord, dorsal nerve cord Subphylum Cephalochordata  Lancelets  25 species  Marine  Invertebrates  Filter feeders  Difference between “uro” & “cephalo” is within sexual organs Subphylum Vertebrata  “Backboned”  Vertebral column of bony elements or cartilage elements   Endoskeleton – most calcified bone, either bone or hardened cartilage  Cranium  HOX genes – 2 clusters, more complexity in development  Neural crest – cells “migrate” Breakdown of Classes Class Myxini  Hagfishes  Marine   30 species  Jawless  Nearly blind  Coated in slime  Skeleton – (weakest skeleton of all groups) have a skull but is not complete. Have  notochord into adulthood  Lack vertebrae? Very poorly developed vertebrae Class Cephalospidormorphi  “Jawless” fishes, lampreys  Lacks jaws, appendages (fins)  Coated in slime  Little over 40 species  Marine and freshwater   Many are parasitic, some are filter feeders  Notochord in adults  Cartilaginous vertebral column Class Chondrichthyes  “Cartilaginous fishes”  Well developed jaws and appendages  Mostly marine  Cartilaginous vertebral column, but better than above  Notochord in adults  Over 850 species of sharks, skates, and rays Class Osteichthyes  “Bony fishes”  Over 24000 species  Bony skeleton or vertebrae (in most)   Some with notochord or cartilaginous vertebrae in adulthood  Jaws & paired appendages  Very successful group in freshwater and marine Class Amphibia  “Living a double life”  First terrestrial vertebral group  Most of them split their life between an aquatic and terrestrial stage  Most lay eggs in water or moist areas can live on land, but are not completely  separated from water *most are reproductively tied to water  Amphibians are the first tetrapod group (4 leg or 4 foot)  Frogs, salamanders, toads  Around 4000 species  Very thin, moist skin. Can dry out very easily Class Reptilia  Turtles, crocodiles, lizards, snakes, dinosaurs  Over 8000 species  Enhanced and well developed kidneys, goal is to conserve water  Much thicker skin than amphibians  Larger brain  Larger limbs and muscles, better at movement than amphibians  Life away from water, truly terrestrial  Amniotic egg – (began in reptiles) NOT laid in water, not reproductively tied to  water. Advanced, shelled egg with 3 internal membranes  o “Shell” with a shell membrane  o Chorion – internal membrane #1, allows for gas exchange within the egg  (oxygen in, CO2 out) o Allantois – internal membrane #2, embryonic waste flap o Amnion – internal membrane #3, encloses the embryo “indoor pond”  because it has fluid. Rather than eggs be laid in water, it has its own water  3 Sexual Reproductive Modes: 1. Oviparous – condition of “egg laying” outside of the body. (fishes,  amphibians, reptiles, birds, mammals) 2. Ovoviviparous – “live­bearing” with retention of eggs but there is NO  maternal connection (fish, reptiles) 3. Viviparous  ­ “live­bearing” with retained eggs and a maternal connection  (placenta – gas exchanges thru this) (reptiles, mammals) Class Aves  Birds  Think “Aves” – aviation  Over 9000 species   Most fly  Evolved from small dinosaurs  Fossils – 150 MYBP  Feathers – also scales, something for protection  Light weight skeleton – air spaces, for flight  Air sacs (lungs) for gas exchange. Flight requires a lot of ATP, so they have a high requirement for oxygen and high metabolism.   Endothermic – internal temperature. Birds and mammals have high body  temperature (fishes, amphibians, and reptiles are ectothermic, meaning their body  heat is determined by outside temp)  Organ reduction  Highly modified forelimbs = wings  Oviparous – carrying around offspring would ad weight and affect their flight Class Mammalia  Over 5000 species  Reptilian ancestor (before birds)  Mammals are the most complex, advanced group of animals  Size range; smallest is 1.5 grams (bat), biggest is up to 100,000 kg (whale)  Fish­like, bird­like, reptile­like mammals (3 species are egg layers)  Hair – thickest integument, for good insulation (traps internal heat) endothermic  Mammary gland (milk glands) for nursing the young  Teeth – heterodont dentition – condition of having different kinds or types of teeth o Incisors, canines, premolars, & molars o Thecodont dentition – the condition where long rooted teeth are imbedded  in sockets of the jawbones o Diphyodont dentition – condition of having two sets of teeth in a lifetime  (baby teeth replace by adult teeth)  Increased skull size (braincase) specifically the front part, nervous system o 55:1 (brain: spinal cord) largest difference   Pinna – flap of cartilage and loose connective tissue to funnel sound waves into the outer ear o 3 middle ear ossicles  Dentary – large single bone below your jaw  Viviparous (except 3 species) (placenta) Order Primates  Characteristics include: o Grasping digits o Flattened face o Flat nails rather rounded claws o Binocular vision o Complex learning behaviors o Enhanced sense of touch (hair) there are more sensory receptors in the  skin of mammals than any other animal o Enhanced parental investment of offspring, longer term relationships with  their young o Vision is typically better than the sense of smell o Increased ratio of brain to body size Taxonomy of Man Kingdom Animalia  Phylum Chordota   Subphylum Vertebrata    Class Mammalia     Order Primates      Suborder Anthropoidea       Superfamily Hominoidae        Family Hominidae         Subfamily Homininae          Tribe Hominine           Genus Homo            Species  Homo  sapiens “wise humans” Figure 32.3, Table 32.3, 33.8 EXAM 1!!!! PENCILS


Buy Material

Are you sure you want to buy this material for

75 Karma

Buy Material

BOOM! Enjoy Your Free Notes!

We've added these Notes to your profile, click here to view them now.


You're already Subscribed!

Looks like you've already subscribed to StudySoup, you won't need to purchase another subscription to get this material. To access this material simply click 'View Full Document'

Why people love StudySoup

Bentley McCaw University of Florida

"I was shooting for a perfect 4.0 GPA this semester. Having StudySoup as a study aid was critical to helping me achieve my goal...and I nailed it!"

Janice Dongeun University of Washington

"I used the money I made selling my notes & study guides to pay for spring break in Olympia, Washington...which was Sweet!"

Bentley McCaw University of Florida

"I was shooting for a perfect 4.0 GPA this semester. Having StudySoup as a study aid was critical to helping me achieve my goal...and I nailed it!"

Parker Thompson 500 Startups

"It's a great way for students to improve their educational experience and it seemed like a product that everybody wants, so all the people participating are winning."

Become an Elite Notetaker and start selling your notes online!

Refund Policy


All subscriptions to StudySoup are paid in full at the time of subscribing. To change your credit card information or to cancel your subscription, go to "Edit Settings". All credit card information will be available there. If you should decide to cancel your subscription, it will continue to be valid until the next payment period, as all payments for the current period were made in advance. For special circumstances, please email


StudySoup has more than 1 million course-specific study resources to help students study smarter. If you’re having trouble finding what you’re looking for, our customer support team can help you find what you need! Feel free to contact them here:

Recurring Subscriptions: If you have canceled your recurring subscription on the day of renewal and have not downloaded any documents, you may request a refund by submitting an email to

Satisfaction Guarantee: If you’re not satisfied with your subscription, you can contact us for further help. Contact must be made within 3 business days of your subscription purchase and your refund request will be subject for review.

Please Note: Refunds can never be provided more than 30 days after the initial purchase date regardless of your activity on the site.