×
Log in to StudySoup
Get Full Access to UF - BSC 2000 - Class Notes - Week 1
Join StudySoup for FREE
Get Full Access to UF - BSC 2000 - Class Notes - Week 1

Already have an account? Login here
×
Reset your password

UF / Biology / BSC 2000 / What is binary fission?

What is binary fission?

What is binary fission?

Description

School: University of Florida
Department: Biology
Course: Microbiology
Professor: Asghari
Term: Spring 2016
Tags: microbio, micro, and Microbiology
Cost: 25
Name: Week 1 of Notes for Dr. Asghari's Exam 2
Description: These notes cover what is going to be in our next Exam.
Uploaded: 02/02/2016
5 Pages 13 Views 4 Unlocks
Reviews

Hans Farrell PhD (Rating: )

What an unbelievable resource! I probably needed course on how to decipher my own handwriting, but not anymore...



Tuesday, February 2, y 


What is binary fission?



MCB2000­ Exam 2 Notes 

Genetics

­ GMO­ genetically modified organism, manipulating a seed or bacteria to have a  desired effect

­ Eukaryotic Cell: more complex, has 2 or more chromosomes, mitochondria &  chloroplasts have their own DNA that carries additional genes 

­ Prokaryotic Cell: simpler, DNA is THE genetic material  

­ Bacteria: has 1 chromosome 

­ Extra chromosome is available on DNA 

­ Virus: Acellular, have DNA or RNA, only viruses can have one or the other, may have single stranded DNA (always the exception)

­ DNA is a polymer of Nucleic Acid­ Nucleic Acid is made up of Nucleotides, double  stranded, connected together by hydrogen bonds, its helix shape makes it compact


What is­ genetically modified organism?



­ Duplicating DNA: relax DNA, separate two strands, make a copy for each one, then  have two

­ Nucleotide: sugar, phosphate, nitrogen base (ATCG) 

­ All cells have double stranded DNA, including plasmid, chloroplasts, and  mitochondria

Genes

­ segments of chromosome code for a specific protein­ called a gene ­ not all DNA are genes, only segments of genes 

­ some genes made code for an RNA molecule that is not coded for a protein ­ Virus­ few hundred genes 

1

Tuesday, February 2, y 

­ Bacteria­ couple thousand genes 


The segments of chromosome code for a specific protein­ called what?



­ Humans­ tens of thousands of genes (in Eukaryotes) We also discuss several other topics like What is anarchism?

­ every gene has a start and an end 

­ every gene has to be expressed, this happens in the form of RN ­ every gene copes for one molecule of RNA 

­ more complex the organism is, the more genes it has 

­ Vertical Gene Transfer: from parent gene directly to daughter gene 

­ Horizontal Gene Transfer: in bacteria, conducted through conjugation, transformation, and transduction

­ Conjugation: there is direct contact, DNA is copied from the daughter and the copy of  DNA is transferred to the recipient, there is a Vector that carries the DNA­ the  plasmid, disease­causing genes are passed on through this conjugation, virulence  genes, antibiotic resistance genes

­ Transformation: pick up DNA from the environment (naked DNA), no direct contact,  DNA comes from other cells that die and cause DNA to be free, this process isn't very common, use this in lab to introduce genes into bacteria­ can be in the form of  plasma If you want to learn more check out What is phylogenetic tree?

­ Transduction: virus, attack one host­picks of DN fragment­ transfer to another host,   happens very naturally, carry toxic genes from one bacteria to another, involved in  spreading resistant genes, do not kill the host just carry the genes from one host to  another

­ Transposons­ carry genes from one bacteria to another, can jump from chromosome  to plasmid or from plasmid to chromosome, help plasmid to carry gene from  chromosome also, sometimes called jumping genes

2

Tuesday, February 2, y 

Replication of DNA 

­ Binary Fission: the cell doubling, replication (exact copy of the DNA) 

­ Enzymes involved in replication: helicase­ unwinds the DNA and opens it up, Primate Synthesizes the RNA primer & is required to start replication, DNA polymerase­  adding bases to the new DNA chain; proofreading the chain for mistakes & removes  primer­closes gaps­repairing mismatches, Ligase­ final binding of nicks in DNA during synthesis and repair, Topiosomerases­ supercoiling and untangling

­ Bacterial DNA circulator: 

­ Duplicating DNA: relax DNA, separate two strands, make a copy for each one, then  have two

­ 3 Prime side of strand, and 5 prime side of strand, the replication always goes from 5  to 3, DNA polymerase always synthesizes in one way If you want to learn more check out What is the function of sensory system?

­ Replication always starts at one point ORI, it is Bi­directional­ it goes both ways, goes from 5­3 direction 

­ Replication is semi­conservative (one strand is old from the parent cell, one strand is  new)

­ the two strands are complimentary, G —> C, C —> G (3 hydrogen bonds), A —> T, T —>  A (2 hydrogen bonds), two strands are anti­parallel (5­3, then 3­5)

­ You can tell one strand from the other by regarding the Anti­parallel aspect and the  complimentary aspect

­ To start replication you need a Primer, RNA 

­ during replication one strand is segments and one strand is in one piece 

­Replication SUMMARIZED: Double stranded, one chromosome, circulator, super  coiled­compact molecule, always starts at ORI, moves in both directions, goes 5’—3’  direction, needs a RNA primer to start, semi­conservative, the two strands are  complimentary, are antiparallel, LIGASE&SIMPLE DIAGRAM OF RE

3

Tuesday, February 2, y 

­ Genomic: the study of genes and structures 

­ Bioformatic: the science of comparing DNA If you want to learn more check out What is digital data?

Transcription

­ from DNA to RNA, read DNA and then make RNA 

­ transcription:  

­ making copy of DNA in form of RNA 

­ has multiple forms, tRNA­ mRNA­ rRNA 

­ all microbes in protein synthesis  If you want to learn more check out How are ecology and evolution related?
If you want to learn more check out What is the capital city of sudan?

­ segments of DNA that code for RNA segment is called a gene 

­ some RNA molecules are made to make protein, some are not 

­ mRNA: codes for protein, where info comes from to make a protein, CODON­ used  as a template for making the protein

­ tRNA: help synthesize the protein coded for by mRNA 

­ RNA polymerase uses DNA as a template, it then reads the gene, and then  synthesizes RNA

Translation

­ Protein synthesis/translation, end result is a protein molecules 

­ the size and composition of ribosome in human is different from those in bacteria ­ happens at the Ribosome (every cell must have a ribosome) 

­ Ribosome is a complex molecule made of proteins plus RNA 

­ mRNA transcript reads the mRNA and uses it as a template to 

4

Tuesday, February 2, y 

­ mRNA carries Codon for Amino Acid, a strand of molecule made of GCUA, every 3  base pair is a Codon

­ Codons are triplets­ each Codon for a different Amino Acid, different combinations  code for different things

­ Ribosome hooks the tRNA and Amino acid together 

­ tRNA has a matching codon, an anti­codon 

­ Initiation: first step of translation, mRNA is sandwiched between two ribosome 

­ Elongation: second step of translation, a new amino acids and the polypeptide chain  is growing

­ UNDERSTAND CONCEPT OF EACH STEP 

­ Termination:  

Point Mutations

­ Spontaneous Mutations: mistakes naturally made by DNA polymerase, key is to have mistakes fixed

­ Fidelity of Mutation:  DNA polymerase will go and correct itself and repair anything  that went wrong

­ Frameshift happens halfway through where you either add a base pair or remove a  base pair

5

Page Expired
5off
It looks like your free minutes have expired! Lucky for you we have all the content you need, just sign up here