New User Special Price Expires in

Let's log you in.

Sign in with Facebook


Don't have a StudySoup account? Create one here!


Create a StudySoup account

Be part of our community, it's free to join!

Sign up with Facebook


Create your account
By creating an account you agree to StudySoup's terms and conditions and privacy policy

Already have a StudySoup account? Login here

Study Guide SAS/PLS 12

by: Lauren Murvihill

Study Guide SAS/PLS 12 SAS 12

Lauren Murvihill

Preview These Notes for FREE

Get a free preview of these Notes, just enter your email below.

Unlock Preview
Unlock Preview

Preview these materials now for free

Why put in your email? Get access to more of this material and other relevant free materials for your school

View Preview

About this Document

Everything we need to know for the midterm on Friday!
Plants and Society
Professor Drakakaki
Study Guide
SAS 12, PLS 12, Study Guide, midterm, plant science, Biology, drakakaki, plants and society
50 ?




Popular in Plants and Society

Popular in Plant Science

This 8 page Study Guide was uploaded by Lauren Murvihill on Wednesday February 17, 2016. The Study Guide belongs to SAS 12 at University of California - Davis taught by Professor Drakakaki in Winter 2016. Since its upload, it has received 53 views. For similar materials see Plants and Society in Plant Science at University of California - Davis.

Similar to SAS 12 at UCD

Popular in Plant Science


Reviews for Study Guide SAS/PLS 12


Report this Material


What is Karma?


Karma is the currency of StudySoup.

You can buy or earn more Karma at anytime and redeem it for class notes, study guides, flashcards, and more!

Date Created: 02/17/16
Study Guide What are some unique and economically important crops to California? Almonds, peaches, walnuts, artichokes, figs, grapes, pomegranates, dates, pistachios, olives.  What happened during the Irish potato famine? During the Irish potato famine, a fungal disease caused a potato blight. The fungal disease was  so widespread because the potato crop in Ireland was genetically uniform, meaning that almost  all the potatoes in Ireland were susceptible to the fungal disease. Since the Irish were solely  dependent on this one crop, it had devastating results. Over one million people died because of  this potato blight. What are the differences between monocotyledonous and dicotyledonous plants? A monocotyledonous plant has one seed leaf, leaf sheaths and blades, and fibrous roots. Its  nutrients are primarily stored in the endosperm, and its leaves are long and narrow with parallel  veins. Examples of a monocotyledonous plants are wheat, barley, and rice. A dicotyledonous  plant has two seed leaves, lateral roots, and visible veins on its leaves. Its nutrients are primarily stored in the cotyledons, and its leaves are broad with net­like veins. Examples of a  dicotyledonous plant are tomatoes, soybeans, and strawberries. What are the functions of roots, stems and leaves in cellular terms?  Roots anchor plants into the soil, take up water and minerals, and store starch. Stems transport  nutrients, minerals, wastes, and food to various parts of the plant. Leaves take in sunlight and  carbon dioxide and release water and oxygen in a process called photosynthesis, which is how  a plant makes energy for itself. From what precursor tissue/cells are these organs derived from?  Meristems. *What are the cell types of dermal tissue?  Epidermal cells and periderm cells. What substances are moving through the vascular systems of plants? Water, solutes, food, and some hormones. Are there different pathways for different substances?  Xylem transports water and solutes from the roots to the leaves. Phloem transports food from  the leaves to other parts of the plants. What are the cell types of vascular systems?  Vessel elements, tracheids, pits, parenchyma cells, sieve tube cells, companion cells, and  plasmodesmata. What are imperfect and perfect flowers?  Perfect flowers have both male and female reproductive organs. Imperfect flowers have either  male or female reproductive organs, or one is not fully developed. How do these different types of flowers reproduce?  Perfect flowers can self­pollinate while imperfect flowers rely on outsiders such as bees to  pollinate them. Natural selection and traditional breeding have produced many new varieties of fruits  and vegetables we see in the supermarket today. What are some examples of these  varieties and which plant parts are we consuming? The new varieties of fruits and vegetables we see today have bigger plant parts. We eat plant  roots, leaves, flowers, fruits, seeds, and stems. An example of this phenomenon is corn: ancient corn had tiny seeds, while modern corn seeds are big. What are the parts of a fruit? What is a seed? There are two parts of a fruit: the seed, and the pericarp. A seed is a plant’s unit of reproduction  that can develop into another plant. It is made of the endosperm, embryo, and seed coat. The  pericarp is made of the endocarp, mesocarp, and exocarp. What are some similarities/differences between plants and animals? Plants and animals have the ability to grow. However, animals reach a point where they stop  growing, and if they cannot grow new body parts. Plants, on the other hand, are constantly  growing and never stop; should they lose a leaf, they can grow a new leaf to replace it. What organelles are in a typical plant cell? Which organelles are plant­specific? Typical organelles in a plant cell are the endomembrane system, endoplasmic reticulum, golgi  apparatus, vacuole, cell wall, chloroplasts, mitochondria, and peroxisomes. Plant­specific  organelles are vacuoles, cell walls, chloroplasts, and plasmodesmata. What are the functions of plant organelles?  Plant organelles keep the plant alive by carrying out several processes such as photosynthesis  and waste collection. Trafficking systems of cells: how is material transported to other parts of the  cell/organelles? What about secreted material? What is the endomembrane system? What organelles are involved? The endomembrane system divides the cell into structural and functional compartments. The  organelles involved are the endoplasmic reticulum, golgi apparatus, and vacuole. What are hormones? Name the primary plant hormones and describe their functions and  applications. Hormones are chemical messengers that are produced in cells or tissues and modulate cellular  processes in another cell or tissue. The primary plant hormones are auxins, abscisic acid, and  gibberellins. Auxins promote cell growth, root development, and influences differentiation.  Abscisic acid is produced when the environment becomes stressful. Gibberellins promote cell  growth. What is biotechnology? Biotechnology means any technological application that uses biological systems, living  organisms, or derivatives thereof, to make or modify products or processes for specific use. What is recombinant DNA? The combination of two artificial DNA strands. What is The Central Dogma in molecular biology? Transcription (DNA to mRNA) and translation (mRNA to proteins). What is the universal genetic code? The set of DNA and RNA sequences that determine the amino acid sequences used in the  synthesis of an organism's proteins. ⇒  What is DNA? Where is it located (which organelle) in the cell? DNA carries genetic information, is self­replicating, and exists in almost all living organisms. It is located in the nucleus. What is DNA composed of? DNA is composed of nucleotides which contain a phosphate group, a sugar, and a nitrogen  base. The four types of nitrogen bases are adenine, thymine, guanine, and cytosine. What are the differences and similarities between DNA and RNA? DNA is double stranded while RNA is single stranded. Both are composed of nucleotides. DNA  undergoes transcription. What are proteins composed of? Amino acid chains. Where do the processes of transcription and translation occur in a plant cell? Transcription occurs in the nucleus while translation occurs in the cytoplasm. List two functions of the promoter region of a gene. Promoters initiate transcription of a particular gene and affects when, where, and how much of  gene product is produced. List 4 biological roles of transcription factors. Transcription factors help with development, respond to intercellular signals, respond to  environment, and help with cell cycle control. What is RNA interference? How can this be taken advantage of in biotechnology? RNA interference is a process in which inhibit gene expression by destroying the specific mRNA molecules. This can be taken advantage of in biotechnology to help scientists express or inhibit  genes. List methods of analysis of DNA, RNA and proteins (i.e. if you wanted to determine the  presence/amount of a gene or transcript or determine presence/function of a protein,  etc.) PCR, hybridization, genomics, chromatography, enzymatic assays, immunochemistry, and  proteomics. What is PCR (polymerase chain reaction) and what is it used for? PCR is used to amplify specific regions of a DNA strand. This DNA strand can be a single gene, just a part of a gene, or a non­coding sequence. What is totipotency? It is the ability of a single cell to divide and produce all the differentiated cells in an organism. What is plant transformation? Plant transformation allows for the modification of the genetic material of the plant by other  means than conventional breeding or mutagenesis. What are the aims of plant transformation? To create plants that are more beneficial for human use. What are the four general steps in any transformation protocol? 1. Construction of recombinant DNA 2. Production of multiple copies of the recombinant DNA =  gene cloning 3. Introduction of the engineered recombinant DNA into a plant chromosome or  chromosomes = plant transformation 4. Regeneration of whole plants from single cells carrying  the novel gene. What role does a selectable marker gene or a reporter play in plant transformation? It causes plants to transform. A selectable marker is a gene introduced into a cell, especially a  bacterium or to cells in culture, that confers a trait suitable for artificial selection.  How is transient expression facilitated and what are the advantages compared to stable  transformation and expression? Transiently transfected cells express the foreign gene but do not integrate it into their  genome. Thus the new gene will not be replicated. These cells express the transiently  transfected gene for a finite period of time, usually several days, after which the foreign  gene is lost through cell division or other factors. The advantages of transient expression is  that it is better for short­term experiments and causes more rapid results. What is a transgenic crop? A crop that has been genetically engineered. List different methods by which plant transformation and DNA delivery is achieved. What are differences and what are the similarities between these different methods? Plant transformation and DNA delivery is achieved Where does photosynthesis take place within the plant? Where exactly in the cells? (hint: What organelle is photosynthetic?) Photosynthesis takes place in the chloroplasts. The light reactions occur in the thylakoids and  photophosphorylation occurs in the lumen. Plants are capable of converting energy through photosynthesis. Where does the initial  energy come from? And what do they convert it to during photosynthesis? The initial energy comes from the sun in the form of light energy. During photosynthesis, light  energy is combined with carbon dioxide and water to create oxygen and food (sugar). How is solar energy used during light reactions and what processes are occurring during dark reactions? In Photosystem II of the light reactions, an electron gets excited (from a photon) and travels  down the electron transport chain, causing hydrogen protons to be released into the lumen.  Extra hydrogen protons are used for ATP synthesis. In Photosystem I of the light reactions,  NADP+ is reduced to NADPH in the stroma. During the dark reactions, the ATP and NADPH  produced during the light reactions is used to convert carbon dioxide into sugar. NADPH and  ATP are oxidized back into NADP+ and ADP, respectively, after this is completed. These  molecules then return to the light reactions to be used again. What are the products of photosynthesis and what inputs are used to produce these  products? The products of photosynthesis are oxygen and food (sugar). The inputs used to produce these  products are carbon dioxide, water, and sunlight. Plants have the dilemma of daily starving and thirsting. Why does this happen? What  plant parts are involved in regulating a balance? Plants take in the carbon dioxide required for photosynthesis through its stomata, but when they open their stomata to take in this gas, they “accidentally” release some water, too. The stomata, cuticle, and boundary layer help to regulate how much water is lost. There are a wide range of solar radiation frequencies. What frequencies can we see and  what are those preferable during photosynthesis? We can see radiation in the “visible spectrum” or anywhere between 400 and 700 nm. The  preferable solar radiation frequency for photosynthesis is around 450 nm or 650 nm. Why is chlorophyll green? Chlorophyll, the main pigment in the leaf, absorbs red and violet wavelength of the visible  spectrum while green is reflected. What are the differences between C3 and C4 plants, and what are some examples of the  two? C3 plants go through the Calvin cycle and use RUBISCO to help carbon dioxide that it takes in  from the air combine with sugar to make a 3­carbon molecule. C3 plants are rice, wheat, and  barley. C4 plants have adapted a way to lose less carbon dioxide from photorespiration by  saturating RUBISCO with carbon dioxide instead of letting it be exposed to oxygen. C4 plants  are corn and sugarcane. What are CAM plants? What are a few examples of these and what types of habitats do  they inhabit? CAM plants are those that keep their stomata shut during the day and open at night so that they reduce the amount of water lost through transpiration. CAM plants are cacti and pineapples.  They inhabit hot, arid environments such as deserts. Why is RUBISCO so vitally important? RUBISCO is so vitally important because it is a catalyst carbon fixation, which is the first step in  making sugar for plants. Without it, plants would die because from not being able to make sugar fast enough or at all. What is the primary source of energy on earth? The sun. What is the biological process that captures that energy? Photosynthesis and cellular respiration. Where does the oxygen produced in photosynthesis originate from? The oxygen produced in photosynthesis originates from the splitting of water molecules in the  lumen. What is the Calvin cycle, and what are the basic and most important reactions in this  cycle? The Calvin cycle, also known as the dark reactions, occurs in the stroma of the chloroplast. It  uses ATP and NADPH to convert carbon dioxide into sugar. After this process is completed,  ATP is turned into ADP and NADPH is turned into NADP. ATP provides the energy to run these  reactions, and NADPH has reducing powers that allow it to add electrons and form sugar. What structural as well as enzymatic differences exist between C4 and C3 plants? C3 plants carry out their light­dependent and Calvin­Benson reactions in the same place at the  same time: in the mesophyll cells during the day. C4 plants carry out their light­dependent and  Calvin­Benson reactions at the same time, but in different places: the light reactions take place  in the mesophyll cells while carbon fixation occurs in the bundle sheath cells. The main  enzymatic different between the two is that an extra enzyme, PEP, is required in C4 cells to bind incoming carbon to a three­carbon compound. Can vegetarianism help alleviate world hunger? Why? Yes, vegetarianism can help alleviate world hunger by cutting out the number of trophic levels  energy passes through in order to sustain another organism. For example, grain is converted  into energy stores in the bodies of humans and other animals at an efficiency of about 10%.  Therefore, about 10 times as much grain is required if people obtain their energy by consuming  a farm animal rather than directly consuming the grain How much energy do you gain or lose when moving between 1 trophic level and  another? You only gain 10% of the energy when you move from one trophic level to another.  What is the difference between phototrophs and heterotrophs? Which are plants? Phototrophs are any organism that relies on light as its provider of energy. Heterotrophs are any organism that cannot manufacture its own food and instead obtains its food and energy by  taking in organic substances, usually plant or animal matter. Plants are phototrophs. How do carbohydrates contribute to plants? Carbohydrates are an energy and structure source for plants. *How can you reduce the amount of energy used in agricultural production processes? You can reduce the amount of energy used in agricultural production processes What is the position that plants occupy in the food chain? Plants occupy the very first level in the food chain, or the autotroph level. They are producers. Which fatty acids are likely to be fluid at room temperature? Unsaturated fat molecules are fluid at room temperature. Carbohydrates and complex carbs ­ what are their contributions to plants? Carbohydrates provide structure and energy for plants. Complex carbs make glucose, which is  more energy for plants. What is symbiosis? The interaction between two different organisms living in close physical association, typically to  the advantage of both. What are the mechanisms of nitrogen fixation? In nitrogen fixation, nitrogen in the atmosphere is converted into ammonium. This is done  through lightening, which produces some ammonia, biologically through symbiosis or microbes,  or industrially. What is in leguminous plants that is so important? Rhizobia is in leguminous plants. They are soil bacteria that fix nitrogen in the form of ammonia. What are essential amino acids? What are they good for and where do they come from?  Are they all coming from plants? Essential amino acids are proteins that your body needs, but does not synthesize. They are  good for keeping people healthy, and they come from food. Not all come from plants. What are the general human population trends throughout time and across regions? The human population has exploded. What are factors in the shifting in these trends across regions? High total fertility rate, desire for large families, and lower infant mortality caused this trend. Did the spice trade have a significant impact on trade, colonization, and history? Yes, the spice trade allowed goods to travel to other countries which increased trade and  colonization and impacted history. What is carrying capacity? What are the relevant theories of carrying capacity? We have  Malthusian as well as many other divergent views ­ ponder the implications and realities  of these theories. Carrying capacity is the maximum population that can be supported by natural resources for  present and future generations and the maximum rate of resource consumption and waste  discharge that can be sustained. The relevant theories of carrying capacity is Neo­ Malthusianism and Non­Malthusianism. Neo­Malthusianism is divided into two parts: Ecological  Malthusians and Protectionist Malthusians. Ecological Malthusians state that population growth  undermines the natural resource base. Protectionist Malthusians observe the consequences of  population growth on jobs, service, education, etc. Non­Malthusians believe that due to modern  technology, human population will not exceed the amount of resources necessary for  everyone’s survival. What are the classic stages of demographic transition? Demographic transition is accompanied by age transition. If the birth rate and death rate  change, this causes changes in demographics. How does this apply to a developed versus a developing country? What are main  characteristics of a varietal improvement?  In a developed country, the birth rate and death rate do not change much. In a developing  country, the birth rate and death rate fluctuate. The objective of the variety improvement  programs is to develop better­adapted high­yielding varieties that have superior grain qualities;  early and uniform maturity within each maturity group; good seedling vigor; short stature and  lodging resistance; and disease, insect, and blanking resistance. From John Labavitch's lecture on Pierce’s disease: Briefly explain the major points of the case study. What are the different parts of the plant they are using in their system? Is the work they are doing different from genetic modification and how is it different? What  were the research questions and conclusions? What “infectious agent” causes the disease? A bacterium called Xylella fastidiosa. How is the  disease spread from plant to plant? An insect that feeds on the xylem cells of the vine. How  does the causal agent move in the plant? It moves through the vine’s water pipes; how it moves  is not clear. What is the ultimate impact of PD on the grapevine? It kills the vine; how it kills is  not clear. Plants develop their own natural compounds which humans use for medicinal purposes.  Why do plants develop these compounds and how have humans exploited these  resources throughout history? Plants develop these compounds as a mode of defense against predators. Humans have  exploited these resources throughout history so that they can also benefit from these defense  compounds. What are the advantages and disadvantages of herbal medicines? The advantages are that they are natural and do not have added chemicals or preservatives  that can be harmful to humans. The disadvantages is that they are unregulated and untested,  so they may be dangerous. Additionally, doses are inconsistent and can interact with other  things previously consumed, causing death. List some pharmaceuticals that are derived from plants. Morphine, aspirin, cancer treatments, and malaria treatments. Are all the medicinal products developed today tested by the FDA for safe human  consumption? Not all medicinal products have been tested by the FDA for safe human consumption. What are Centers of Origin? How are they determined scientifically? What are their main  features? Centers of Origin are areas of interaction of wild relatives, climate, and human needs such as  preferences and traditions that were determined where crops were first domesticated. Centers  of Origin are scientifically determined by observing the geographic distribution of wild relatives,  making genetic studies of crop and wild relatives by comparing DNA sequences and taking  crosses between crops and relatives, and archaeological studies using carbon­14 dating of  plant remains. There are six Centers of Origin: Fertile Crescent, Mesoamerica, China, Africa,  South America, and North America. During transitions from hunter gatherers to adoption of agriculture, what was the main  changes that characterized these events? Society changed from being centered around hunters and gatherers to being centered around  herder and farmer (agricultural) societies. It caused humans to settle down in one area where  crops could be grown, and society changed from more egalitarian to more hierarchical. What are the effects of agricultural development in societies? Crops and farm animals became domesticated. What is domestication? The process of conscious selection of plants and animals such that they fit the needs and  desires of humans. Approximately how many years ago were the first crops domesticated and did  agriculture begin? About 10,000 years ago. What major crops domesticated from the Fertile Crescent (Near East), Mesoamerica,  China, and Africa? Fertile Crescent: wheat, barley, rye, oats, peas, chickpeas, lentils, safflower, grapes, figs, date  palms, onions, and lettuce. Mesoamerica: corn, beans, peppers, squash, sweet potato, tomato, vanilla, avocado, papaya,  guava, cotton, and cacao. China: rice, pearl millet, soy beans, red beans, cabbage, oranges, limes, grapefruits, and tea. Africa: sorghum, pearl millet, African rice, cowpea, yams, oil palm, okra, watermelon, and  coffee. What are the possible reasons for crop domestication? To create crops that are more beneficial for human consumption. Give examples of traits of domesticated plants that differ from those in their wild  relatives (think of the things we really want to change for our own consumption). Different plant parts are bigger than their wild counterparts, such as their roots, leaves, seeds,  fruits, etc. This is because this is the part of the plant that humans consume. What is germplasm? Genetic material transmitted from one generation to another. Describe methods of preserving crop genetic resources over the long term. The Svalbard Global Seed Vault (Doomsday Vault) close to the North Pole that preserves crop  genetic resources over the long term. It is one of a few locations that holds seeds in a gene  bank. Should a crop disappear, it can be grown again using seeds from the gene bank.


Buy Material

Are you sure you want to buy this material for

50 Karma

Buy Material

BOOM! Enjoy Your Free Notes!

We've added these Notes to your profile, click here to view them now.


You're already Subscribed!

Looks like you've already subscribed to StudySoup, you won't need to purchase another subscription to get this material. To access this material simply click 'View Full Document'

Why people love StudySoup

Jim McGreen Ohio University

"Knowing I can count on the Elite Notetaker in my class allows me to focus on what the professor is saying instead of just scribbling notes the whole time and falling behind."

Janice Dongeun University of Washington

"I used the money I made selling my notes & study guides to pay for spring break in Olympia, Washington...which was Sweet!"

Bentley McCaw University of Florida

"I was shooting for a perfect 4.0 GPA this semester. Having StudySoup as a study aid was critical to helping me achieve my goal...and I nailed it!"


"Their 'Elite Notetakers' are making over $1,200/month in sales by creating high quality content that helps their classmates in a time of need."

Become an Elite Notetaker and start selling your notes online!

Refund Policy


All subscriptions to StudySoup are paid in full at the time of subscribing. To change your credit card information or to cancel your subscription, go to "Edit Settings". All credit card information will be available there. If you should decide to cancel your subscription, it will continue to be valid until the next payment period, as all payments for the current period were made in advance. For special circumstances, please email


StudySoup has more than 1 million course-specific study resources to help students study smarter. If you’re having trouble finding what you’re looking for, our customer support team can help you find what you need! Feel free to contact them here:

Recurring Subscriptions: If you have canceled your recurring subscription on the day of renewal and have not downloaded any documents, you may request a refund by submitting an email to

Satisfaction Guarantee: If you’re not satisfied with your subscription, you can contact us for further help. Contact must be made within 3 business days of your subscription purchase and your refund request will be subject for review.

Please Note: Refunds can never be provided more than 30 days after the initial purchase date regardless of your activity on the site.