Limited time offer 20% OFF StudySoup Subscription details

MiraCosta College - BIOL 204 - Spring 2016 - Unit 2 Study Guide -

Created by: David Edwards Elite Notetaker

> > > > MiraCosta College - BIOL 204 - Spring 2016 - Unit 2 Study Guide -

MiraCosta College - BIOL 204 - Spring 2016 - Unit 2 Study Guide -

5 5 3 59 Reviews
This preview shows pages 1 - 5 of a 27 page document. to view the rest of the content
background image Eukaryotic Complex cells that 
contain membrane 
enclosed organelles in 
an endomembrane 
system as well as other 
significant sturcures
Usually complex single­
celled or multicellular 
organisms Prokaryotic Simpler cells containing
a plasma membrane 
enclosing cytoplasm 
and usually a single 
strand of DNA Bacteria and Archaea Some of the first 
organisms known
Nucleoid Region of the cytoplasm 
within a prokaryotic cell 
that contains a supercoil
DNA genome Capsule Outside cell wall of a 
prokaryotic cell made of 
carbohydrate molecules 
that can form a “slimy 
layer”  virulence factor to evade
immune recognition a 
host
Fimbriae Finger­like projects that 
enable prokaryotic cells 
to adhere to surfaces, 
each other, or to host 
cells.
Virulence factor to cling 
to host cells and even 
past genetic information 
to each other including 
resistance genes  Flagellum  Propeller­like motion 
powered by membrane­
embedded motors with 
energy from ATP for 
locomotion
Virulence factor to 
evade immune cells of a
host Organelle Membrane­enclosed 
subcellular 
compartments with 
specialized functions
Extracellular Matrix Structure composed of 
carbohydrates, 
glycolipids and 
glycoproteins that add 
structural rigidity to cells
Cell Wall Outside of a plasma 
membrane in both 
prokaryotes and 
eukaryotic plant cells In prokaryotes: consists
of protein and 
carbohydrate molecules
called peptidoglycan In eukaryotes: consists 
of cellulose­alternating 
beta­glucose molecules
Plasmodesmata Plasmodesmata are 
microscopic channels 
which traverse the cell 
walls of plant cells and 
some algal cells, 
enabling transport and 
communication 
between them. Although cell walls are 
permeable to small 
soluble proteins and 
other solutes, 
plasmodesmata enable 
direct, regulated,  symplastic intercellular 
transport of substances 
between cells
. Vacuole Large membrane­
enclosed watery 
compartment that aids 
in water balance, 
storing waste, and 
housing hydrolysis 
enzymes (hydrolase) Plastid Double­membrane 
organelle found, among
others, in the cells of 
plants and algae. 
Contain pigments for 
photosynthesis as well 
as a DNA molecule 
similar to that of 
prokaryotes Chloroplast Organelles in which 
sunlight is captured and
used to synthesize 
organic compounds like
sugars producing O2 as
waste in plant cells
Nucleus DNA stored, organized 
and regulated into 
subnuclear domains
Region within known as
nucleolus is clustered 
rRNA genes localized 
and ribosomes are 
assembled here Nuclear Lamina is a 
network of proteins that 
line the inner 
membrane of the 
nucleus and interact 
with chromatin fibers of 
DNA to organize 
background image architecture of the 
nucleus
Chromosome A packaged and 
organized structure 
containing most of the 
DNA of a living 
organism. It is not 
usually found on its own,
but rather is structured 
by being  wrapped  around protein  complexes called 
nucleosomes, which 
consist of proteins called
histones.
Nuclear Envelope Two separate 
phospholipid bilayers 
enclose and regulate 
transport of materials in 
and out of nucleus
Nuclear Pore Channels through the 
nuclear envelope by 
which materials are 
transported in/out Nucleolus Cluster of rRNA and 
where ribosomes are 
assembled before they 
leave the nucleus.
Ribosome serves as the site of 
biological protein 
synthesis. Ribosomes 
link amino acids 
together in the order 
specified by messenger 
RNA molecules.
Ribosomes consist of 
two major components: 
the small ribosomal 
subunit, which reads the
RNA, and the large 
subunit, which joins 
amino acids to form a 
polypeptide chain. Each 
subunit is composed of 
one or more ribosomal 
RNA molecules and a 
variety of proteins.
Rough Endoplasmic 
Reticulum
Studded with 
ribosomes, protein 
synthesis for 
membrane­embedded 
proteins, for specific 
organelles, and to be 
secreted from the cell Smooth Endoplasmic  Reticulum No ribosomes.  Lipid 
synthesis such as 
phospholipids and 
cholesterol for steroid 
hormones
Stores Ca 2+  which can  be released in regulated fashion for stimulation 
of muscle­cell 
contraction and stores 
liver cells detox 
enzymes Golgi Complex Flattened membrane­
enclosed compartments
called cisternae Contains enzymes that 
catalyze carbohydrate 
synthesis and 
glycosylation of proteins
and lipids
Lysosome Contains hydrolytic 
enzymes that degrade 
macromolecules via 
hydrolysis reactions Enables recycling of 
warn­out organelles and
is responsible for 
digesting/breaking 
down ingested material 
that the cell took in Acidic pH to denature 
proteins/molecules
Vesicle Membrane enclosed 
transportation “bubbles” 
used to move materials 
around the cell through 
the cytoplasm Mitochondrion Kidney bean­shaped 
structures bound by a 
double membrane Sites of majority of ATP 
synthesis (powerhouse)
Peroxisome Peroxisomes are 
membrane enclosed 
organelles found in 
virtually all eukaryotic 
cells.  They are involved in the 
catabolism of very long 
chain fatty acids, 
branched chain fatty 
acids
Peroxidase any of a group of 
enzymes that catalyze 
the oxidation of some 
organic substrates in the
presence of hydrogen 
peroxide. Microtubule hollow cylinder that 
transports copied DNA 
to daughter cells during 
cell replication
function as highways for 
vesicles by motor 
proteins Tubulin globular proteins that 
make up walls of 
background image microtubules Microfilament Contribute structural 
support and are more 
dynamic Globular actin is added 
to ends or removed to 
change cell shape and 
movement Actin Globular proteins that 
associate to form the 
fibrous filaments of 
microfilaments
Intermediate Filament mid­sized, static 
structure for cell 
support/shape and 
tethering organelles 
made of fibrous keratin 
proteins Microtubule  Organizing Center The microtubule­
organizing center is a 
structure found in 
eukaryotic cells from 
which microtubules 
emerge.  In animals, the two most
important types of 
MTOCs are the basal 
bodies associated with 
cilia and the centrosome
associated with spindle 
formation.
Centriole  cylindrical cell structure 
composed mainly of a 
protein called tubulin 
An associated pair of 
centrioles, surrounded 
by a shapeless mass of 
dense material, called 
the pericentriolar 
material, or PCM, makes
up a compound 
structure called a 
centrosome. Tight Junction are the closely 
associated areas of two 
cells whose membranes 
join together forming a 
virtually impermeable 
barrier to fluid
Desmosome cell structure specialized
for cell­to­cell adhesion. 
A type of junctional 
complex, they are 
localized spot­like 
adhesions randomly 
arranged on the lateral 
sides of plasma 
membranes.
Gap Junction specialized intercellular 
connection between a 
multitude of animal cell­
types
They directly connect 
the cytoplasm of two 
cells, which allows 
various molecules, 
ions   and electrical impulses 
to directly pass through 
a regulated gate 
between cells.
Selective Permeability Characteristic of cell 
membranes that allow 
the active or passive 
transport of specific 
materials in/out of a cell
Integral Membrane  Proteins Structures embedded in 
the membranes of a cell 
that interact with the 
outside of the cell and 
pass through the 
membrane and interact 
with the inside of the cell
Peripheral Membrane 
Protein 
Proteins that are 
associated with cell 
membranes, but not 
actually embedded 
within Fluid Mosaic Characteristic of cell 
membranes describing 
the unbounded 
phospholipids (fluid) and
the different proteins 
embedded within and 
around the membrane 
(mosaic)
Compartmentalized Fluid The characteristic of cell
membranes describing 
the different areas that 
specific proteins lie Hop Diffusion The ability for certain 
proteins to move around
the phospholipid bilayer 
Lipid Raft A specialized membrane
domain which 
cholesterol and 
Sphingolipid have a high
affinity for one another
May enhance molecular 
interactions with 
activities such as cell 
signaling
FRAP a technique used for 
background image monitoring diffusion of 
membrane components 
by the migration of 
fluorescent components 
to a region that has 
been photobleached.
Single Particle Tracking Process of tagging 
individual proteins or 
lipids with a single 
particle (usually gold) 
and tracking its 
movement with a high­
speed camera to 
observe hop diffusion. Diffusion Simple diffusion: 
molecules move down 
their concentration 
gradient no energy 
required Facilitated diffusion: 
molecules move down 
their concentration 
gradient through 
membrane­embedded 
proteins Osmosis Diffusion of water Osmoregulation Water moving in/out of 
the cell via aquaporins 
to balance if needed. Hypertonic Condition of a cell that 
can cause it to shrivel 
when solute 
concentration is higher 
outside of the cell than 
inside Hypotonic Condition of a cell that 
can cause lysing and 
explosion when solute 
concentration is higher 
inside the cell than 
outside
Isotonic Solute concentration is 
equal inside and outside
of the cell.
Passive Transport  Does not require ATP 
energy to move 
materials such as 
simple/facilitated 
diffusion
Active Transport Requires ATP energy to 
move materials such as 
pumps
Sodium/Potassium 
Pump
Moves Na+/K+ across 
membrane to establish a
concentration gradient High Na+ outside and 
high K+ inside the cell
3 Na+ bind to protein 
inside the cell and ATP 
interaction causes 
shape change and 
releases 3 Na+ to 
outside 2 K+ bind to protein 
outside the cell during 
shape change.  
Phosphate cleaved off 
and 2 K+ released into 
the cell Cotransport Secondary active 
transport (ie Glucose on 
the Na+/K+ pump) once 
concentration gradient is
established, it uses this 
energy instead of ATP to
drive movement of 
materials across 
membrane. Endocytosis Entering of materials 
from outside, into the 
cell Exocytosis Exiting of materials from 
inside the cell to the 
outside. Membrane Potential Difference in ions that 
creates the ability for 
transport of materials 
across a membrane
Channel Protein A specific protein pore in
the membrane of cells to
allow specific molecules 
to pass through 
(polar/charged)
Carrier Protein Protein that changes 
shape to move 
substances across 
membrane Substance binds to 
protein that induces 
shape change leading to
its transport Free Energy Amount of energy 
available to do work 
depends on enthalpy, 
temperature and entropy
Endergonic Products have more free
energy than reactants 
and require energy input
Not spontaneous­
increase in energy state
Exergonic Products have less free 
energy than reactants 
releasing energy
Spontaneous­decrease 
in energy state
Catabolic A reaction that creates 
background image more disorder by 
breaking 
substance/reactants into
smaller parts
Anabolic A reaction that 
organizes reactants into 
a larger more orderly 
product Activation Energy The amount of energy 
required for an 
enzymatic reaction to 
start­energy required to 
cause molecules bonds 
to break
Induced Fit The enzyme­substrate 
binding at the active site 
that causes the enzyme 
to close tight on the 
substrate
Brings chemical groups 
into position to enhance 
the catalysis of reaction Cofactor A molecule that is 
required to bind to an 
enzyme to initiate 
reaction
Usually an atom of metal
or some inorganic 
molecule such as iron, 
zinc, or copper
Coenzyme A cofactor that is usually
an organic molecule like 
vitamins
Allostery A case in which a 
proteins function at one 
site is affected by the 
binding of a regulatory 
molecule to a separate 
site Kinase An enzyme that adds a 
phosphate group to a 
substrate Phosphatase An enzyme that 
removes a phosphate 
group from its substrate Cooperativity When a substrate binds 
to an active site causing 
shape change on the 
enzyme to increase its 
ability of having more 
substrates bind to it
Competitive Inhibition  A molecule resembling 
the substrate binds to an
active site preventing a 
substrate from binding to
the active site
Non­competitive 
Inhibition 
A molecule binds to a 
distal site on an enzyme 
causing shape change 
that prevents a substrate
from binding to the 
active site
Intermediary Metabolism The manner in which 
cells use glucose from 
the food we eat.
Cellular Respiration Potential energy of 
glucose is released 
through oxidation and 
used to synthesize 
ATP
Oxidation/Reduction Reactions in which a 
compound or molecule
loses electrons/control 
over electrons 
(oxidation) and the 
other compound or 
molecule in the 
reaction gains 
electrons/control over 
electrons (reduction) In cellular respiration 
glucose is oxidized 
when converted to 
carbon dioxide and 
oxygen is reduced to 
water  NAD+ The coenzyme 
electron acceptor used
throughout many steps
in cellular respiration in
its oxidized form. NADH The reduced form of 
the coenzyme used 
throughout cellular 
respiration
FAD The coenzyme used 
during the citric acid 
cycle and oxidative 
phosphorylation in its 
oxidized form
FADH2 The reduced form of 
the coenzyme used 
during the citric acid 
cycle and oxidative 
phosphorylation
Glycolysis First part of cellular 
respiration where 
glucose is oxidized to 
pyruvate and NAD+ is 
reduced to NADH
Produces 2 ATP net 
because cell uses 2 
ATP of 4 total created 
to split the glucose 

This is the end of the preview. Please to view the rest of the content
Join more than 18,000+ college students at MiraCosta College who use StudySoup to get ahead
School: MiraCosta College
Department: Biology
Course: Metabolic Biochemistry
Professor: S. Bailey
Term: Spring 2016
Tags:
Name: Unit 2 Study Guide
Description: Study Guide for Final
Uploaded: 05/18/2016
27 Pages 81 Views 64 Unlocks
  • Better Grades Guarantee
  • 24/7 Homework help
  • Notes, Study Guides, Flashcards + More!
Recommended Documents
Join StudySoup for FREE
Get Full Access to MiraCosta College - BIO 204 - Study Guide - Final
Join with Email
Already have an account? Login here
×
Log in to StudySoup
Get Full Access to MiraCosta College - BIO 204 - Study Guide - Final

Forgot password? Reset password here

Reset your password

I don't want to reset my password

Need help? Contact support

Need an Account? Is not associated with an account
Sign up
We're here to help

Having trouble accessing your account? Let us help you, contact support at +1(510) 944-1054 or support@studysoup.com

Got it, thanks!
Password Reset Request Sent An email has been sent to the email address associated to your account. Follow the link in the email to reset your password. If you're having trouble finding our email please check your spam folder
Got it, thanks!
Already have an Account? Is already in use
Log in
Incorrect Password The password used to log in with this account is incorrect
Try Again

Forgot password? Reset it here