×
Log in to StudySoup
Get Full Access to Clemson - MICR 1030 - Class Notes - Week 12
Join StudySoup for FREE
Get Full Access to Clemson - MICR 1030 - Class Notes - Week 12

Already have an account? Login here
×
Reset your password

CLEMSON / Biology / MICR 1030 / In what year did frederick griffith discover the "transformation facto

In what year did frederick griffith discover the "transformation facto

In what year did frederick griffith discover the "transformation facto

Description

School: Clemson University
Department: Biology
Course: General Biology I
Professor: Kristi whitehead
Term: Fall 2015
Tags: CU, Clemson, Clemson University, Dr. Whitehead, Biology, Bio, BIOL 1030, and BIO 1030
Cost: 25
Name: Chapter 10
Description: Chapter 10: Molecular Biology of the Gene SECTIONS: 10
Uploaded: 11/02/2015
7 Pages 48 Views 7 Unlocks
Reviews

James Propst (Rating: )


Will Quillen (Rating: )



Chapter 10: Molecular Biology of the Gene


In what year did frederick griffith discover the "transformation factor"?



SECTIONS: 10.1­10.16

Sections 10.1­10.3: The Structure of Genetic Material 

∙ Molecular biology

o The study of heredity at the molecular level

 DNA is what you inherit from your parents.

o Early 1900s

 It was thought that you inherit proteins from your parents because proteins are complex

 Proteins were thought to be genetic material because proteins are very  complex

∙ Frederick Griffith

o In 1928, he discovered the “transforming factor”

 One factor that transformed one thing to the next

o Used streptococcus pneumoniae to infect mice (pathogenic) and the mouse died  Took another type (non­pathogenic, cannot cause disease) and injected it into  the mouse but it did not die


Who are watson and crick?



 Took another type (pathogenic, but boiled the bacteria first, killing the  bacteria) and injected it into the mouse but it did not die 

 Took another type (killed pathogenic strep + non­pathogenic strep) and  injected the combination into the mouse and it died when it shouldn’t have ∙ Something can transform a pathogenic strep to a non­pathogenic strep ∙ Hershey and Chase We also discuss several other topics like What are the types of sampling design?

o In 1952, the showed that the genetic material was DNA

o Found that DNA was passed along

o What was the e­coli transforming? 

 DNA, not proteins

o Used e­coli and a virus (T2 bacteriophage) that specializes in bacteria  T2 bacteriophage is the experiment subject

 If the bacterium gets infected with a virus, it turns into a virus making  machine until it can’t hold anymore and it releases it into the environment   Radioactive labeled DNA helped figure out that DNA is what is passed along ∙ Figure 10.1 A, Page 182


What are the three steps in translation-elongation?



∙ Figure 10.1 B, Page 183

 First experiment: labeled proteins

∙ Expect to see it in the liquid

 Second experiment: labeled DNA

∙ Expect to see it in the pellet

∙ Figure 10.1 C, Page 183

∙ Structure of DNA and RNA

o Nucleic acids 

 These are polymers of nucleotides

∙ Nucleotides 

o Nitrogenous base

o Sugar

o Phosphate group

o Joined with covalent bonds If you want to learn more check out Who wrote the book "listening to prozac"?

∙ Sugar phosphate backbone

o DNA 

 Deoxyribose 

 Thymine

 Double stranded 

 Figure 10.2 A­3, Page 184

o RNA

 Ribose

 Uracil

 Single stranded

 Figure 10.2 C, Page 185

o Nitrogenous bases are part of the nucleotides 

o Nucleic acids are polymers of the nucleotides  If you want to learn more check out What are the top tactical responsibilities of a pr?

 Figure 10.2 A, Page 184

o Nitrogenous bases

 Purines

∙ Double ringed structure

 Pyrimidines

∙ Single ringed structure

 Figure 10.2 B, Page 185

∙ Watson and Crick (scientists) 

o In 1953, they were able to determine the structure of DNA

o DNA was found from Rosalind Franklin and Maurice Wilkins used x­ray  crystallography and it showed a double helix but they thought it was a triple so she  didn’t believe in her data

o Watson and Cricks Model shows

 Adenine will always equal the amount of thymine and cytosine will always  equal guanine which fits with the Erwin Chargaff’s data

 Chargaff’s Rules

o Watson, Crick and Wilkins were awarded the Nobel prize but not Franklin because  she died of cancer

o Basic Structure of DNA:

 If looking down (looking at the top) on DNA, it is the same thickness  (uniform) We also discuss several other topics like In what year did the court in baird v eisenstadt) legalized birth control for all citizens of the u.s, irrespective of marital status?

 Figure 10.3 C, Page 187

 Figure 10.3 D, Page 187

Sections 10.4­10.5: DNA Replication

o DNA is copied every time a cell wants to replicate

o Very complicated/involves numerous steps

∙ Semiconservative Model of DNA Replication 

o In most DNA replication

o Whenever DNA is replicated (going from one strand to two), what doesn’t happen is  you have the old plus a new, it is that the new strands are made up of one old strand  and one new strand

o New DNA is made of one parent strand and one daughter strand making it  semiconservative 

o Half is new, half is old

 Figure 10.4 A, Page 188

∙ Replication in more detail

o There is multiple origins where DNA can be replicated 

o DNA unwinds and separates from each other to make space for the replication  o In each origin, the hydrogen bonds are broken and replication begins, creating  bubbles at the origin where the machinery can come in and start making new DNA o Goes in both directions until the bubbles are aligned and form the new strands of  DNA through merging Don't forget about the age old question of How foodborne illnesses occur?

 Figure 10.5 A, Page 189

o Reason it can occur in multiple directions is because they are anti­parallel  Running from 5’ to 3’ (how carbons are attached) 

 Other side is 3’ to 5’ 

 DNA replication can only happen in one direction 

 Figure 10.5 B, Page 189

∙ Enzymes involved in replication

o DNA Polymerase

 Adds nucleotides to the daughter strands

 Only adds nucleotides to the 3’ end (5’ to 3’ direction)

 Good at catching mistakes

 Proofreads: If a mistake is made, there is a period of time to fix it

∙ Ex: slows down mutation rates

o DNA Ligase

 Enzyme that takes short pieces of DNA and attaches them together

 Only important on one strand of the DNA 

 Figure 10.5 C, Page 189

 Okazaki fragments are made because the other strand is 3’ to 5’ so it builds a  short stretch, back up, build and DNA Ligase glues them together 

Sections 10.6­10.16: The flow of Genetic Information from DNA to RNA to Protein

∙ Central Dogma 

o DNARNAProteins (see in physical characteristics) 

o TranscriptionTranslation 

 Figure 10.6 A, Page 190

o All of this happens in the cytoplasm in prokaryotes

 Figure 10.7­1, Page 191 Don't forget about the age old question of What flower is significant in buddhism since that they grow out of muddy waters, representing detachment and purity?

∙ Genetic Code

o If you are going to translate something, you need to know what translates it in the  other language 

o How do we go from 4 nucleotides in DNA and RNA to 20 amino acids in proteins?  Genetic code=triplet code 

 Each 3 RNA nucleotides=1 amino acid 

∙ Also known as a codon=”words” 

∙ 64 possible codons => 20 amino acids

∙ Redundancy 

∙ Figure 10.8 A, Page 192

∙ AUG is the important “start” codon 

∙ Translation stops with UAA UAG and UGA

o Redundancy

 Explains the idea of 64 possible codons, but they only have 20 amino acids  More than one codon that can encode for the same amino acid

 UUU and UUC encode for phenylalanine 

o Unambiguous 

 If you have a single codon, there is no doubt to which it encodes for  No doubt as to which it codes for 

 Cannot ever encode for something else 

o Universal 

 Almost any organism, you can be confident 

 Figure 10.8 B, Page 192

o Without “punctuation” 

 Figure 10.8 B, Page 192

 Figure 10.3 D, Page 187

∙ Transcription 

o You’re starting with double stranded DNA

o DNA strands have to separate first

 Same with replication 

 Only one strand will be transcribed 

 U pairs with A in RNA

 Figure 10.9, Page 193

o RNA polymerase

o Promotor starts transcribing

 Tells RNA to combine and start transcribing

o Terminator stops transcribing 

 Causes the RNA to detach, which will stop transcription

o 3 stages:

 Same as translation but different things happen (don’t get confused)

 Initiation 

∙ RNA is going to recognize the promotor 

 Elongation 

∙ RNA starts building the new RNA

 Termination 

∙ RNA recognized terminator and it detaches and transcription will end  ∙ Figure 10.9, Page 193

∙ Transcription and Translation

o mRNA (messenger)

 actually going to be translated

 encodes amino acid sequences

o Location

 Prokaryotic­cytoplasm

∙ RNA Processing

o Happens with eukaryotes

o Several mechanisms

 Addition of cap and tail

 Purposes:

∙ Export from nucleus

∙ Prevent degradation

∙ Can help ribosomes bind

 Splicing

∙ Introns 

o Intervening sequences

o Areas that are going to be cut out before translation occurs

∙ Exons

o Expressed portions

o Remaining parts that will be translated

 Figure 10.10, Page 194

∙ Translation­tRNA

o Main player

o Transfer RNA

 Machinery that does the translating for us

o Interpreter for translation

o 2 part process:

 Recognize appropriate amino acid

 Recognize codon in RNA

 Figure 10.11 A, Page 195

 Figure 10.11 B, Page 195

∙ Through enzyme reactions

∙ Has to have ATP to attach amino acid

∙ Translation­Ribosomes

o Necessary for translation 

o Common for antibiotics

o Holds the mRNA and tRNA together 

 Catalyze the synthesis of polypeptide 

 Figure 10.12, Page 196

∙ Translation

o 3 phases:

 Initiation

∙ Brought together 

∙ Large and small subunits 

 Elongation

 Termination 

o Initiation 

 mRNA, tRNA with 1st amino acid

 ribosomal subunits are brought together

 Figure 10.13 A, Page 196

∙ Translation­Initiation 

o Determines where translation will begin

 Begins at start codon

 Typically AUG

o Occurs in 2 steps:

 mRNA binds to small ribosomal subunit

∙ first tRNA binds at the start codon

∙ Figure 10.13 B, Page 197

 large ribosomal subunit joins small subunit

∙ Translation­Elongation

o 3 steps:

 Codon recognition

 Peptide bond formation

 Translocation

∙ Movement 

∙ tRNA moves out and over to the P site

∙ growing polypeptide chain that moves

∙ Figure 10.14, Page 197

∙ Translation­Termination

o End of translation

o Stop codon reaches ribosome’s A site

 UAA, UAG, and UGA

 Does not code for amino acids

o Everything will fall apart

 Figure 10.15, Page 198

∙ Mutations

o Any time there is a change in the DNA sequence 

o Single base pairs

o Large regions of the chromosome 

 One letter in the DNA changes

o Mutagenesis occurs in 2 ways

 Spontaneous errors

 Exposure to mutagens 

∙ Can specifically cause damage to DNA

∙ Can be chemicals 

∙ Two Categories of Mutations

o Base substitutions­ number of DNA bases that do not change but a letter changes   Silent mutations

∙ Get a change in DNA sequence, but the polypeptide sequence does not change

 Missense mutations 

∙ The DNA sequence change and amino acid sequence changes

o UUUUCU

 Nonsense mutations

∙ DNA sequence changes but changes very specifically that will give 

you a stop codon

∙ Amino acid sequence translation 

∙ Stops rather than getting another amino acid 

o UGCUGA (stop codon)

o Deletions or insertions­ total number of nucleotides that can change (big problem)  After reading frame

 Usually causes significant changes

∙ Geno code is read in groups of 3 and only 3

∙ Location matters

 Figure 10.16 A, Page 199

 Figure 10.16 B, Page 199

Page Expired
5off
It looks like your free minutes have expired! Lucky for you we have all the content you need, just sign up here