Log in to StudySoup
Get Full Access to Clemson - MICR 1030 - Class Notes - Week 12
Join StudySoup for FREE
Get Full Access to Clemson - MICR 1030 - Class Notes - Week 12

Already have an account? Login here
Reset your password

CLEMSON / Biology / MICR 1030 / In what year did frederick griffith discover the "transformation facto

In what year did frederick griffith discover the "transformation facto

In what year did frederick griffith discover the "transformation facto


School: Clemson University
Department: Biology
Course: General Biology I
Professor: Kristi whitehead
Term: Fall 2015
Tags: CU, Clemson, Clemson University, Dr. Whitehead, Biology, Bio, BIOL 1030, and BIO 1030
Cost: 25
Name: Chapter 10
Description: Chapter 10: Molecular Biology of the Gene SECTIONS: 10
Uploaded: 11/02/2015
7 Pages 48 Views 7 Unlocks

James Propst (Rating: )

Will Quillen (Rating: )

Chapter 10: Molecular Biology of the Gene

In what year did frederick griffith discover the "transformation factor"?

SECTIONS: 10.1­10.16

Sections 10.1­10.3: The Structure of Genetic Material 

∙ Molecular biology

o The study of heredity at the molecular level

 DNA is what you inherit from your parents.

o Early 1900s

 It was thought that you inherit proteins from your parents because proteins are complex

 Proteins were thought to be genetic material because proteins are very  complex

∙ Frederick Griffith

o In 1928, he discovered the “transforming factor”

 One factor that transformed one thing to the next

o Used streptococcus pneumoniae to infect mice (pathogenic) and the mouse died  Took another type (non­pathogenic, cannot cause disease) and injected it into  the mouse but it did not die

Who are watson and crick?

 Took another type (pathogenic, but boiled the bacteria first, killing the  bacteria) and injected it into the mouse but it did not die 

 Took another type (killed pathogenic strep + non­pathogenic strep) and  injected the combination into the mouse and it died when it shouldn’t have ∙ Something can transform a pathogenic strep to a non­pathogenic strep ∙ Hershey and Chase We also discuss several other topics like What are the types of sampling design?

o In 1952, the showed that the genetic material was DNA

o Found that DNA was passed along

o What was the e­coli transforming? 

 DNA, not proteins

o Used e­coli and a virus (T2 bacteriophage) that specializes in bacteria  T2 bacteriophage is the experiment subject

 If the bacterium gets infected with a virus, it turns into a virus making  machine until it can’t hold anymore and it releases it into the environment   Radioactive labeled DNA helped figure out that DNA is what is passed along ∙ Figure 10.1 A, Page 182

What are the three steps in translation-elongation?

∙ Figure 10.1 B, Page 183

 First experiment: labeled proteins

∙ Expect to see it in the liquid

 Second experiment: labeled DNA

∙ Expect to see it in the pellet

∙ Figure 10.1 C, Page 183

∙ Structure of DNA and RNA

o Nucleic acids 

 These are polymers of nucleotides

∙ Nucleotides 

o Nitrogenous base

o Sugar

o Phosphate group

o Joined with covalent bonds If you want to learn more check out Who wrote the book "listening to prozac"?

∙ Sugar phosphate backbone

o DNA 

 Deoxyribose 

 Thymine

 Double stranded 

 Figure 10.2 A­3, Page 184


 Ribose

 Uracil

 Single stranded

 Figure 10.2 C, Page 185

o Nitrogenous bases are part of the nucleotides 

o Nucleic acids are polymers of the nucleotides  If you want to learn more check out What are the top tactical responsibilities of a pr?

 Figure 10.2 A, Page 184

o Nitrogenous bases

 Purines

∙ Double ringed structure

 Pyrimidines

∙ Single ringed structure

 Figure 10.2 B, Page 185

∙ Watson and Crick (scientists) 

o In 1953, they were able to determine the structure of DNA

o DNA was found from Rosalind Franklin and Maurice Wilkins used x­ray  crystallography and it showed a double helix but they thought it was a triple so she  didn’t believe in her data

o Watson and Cricks Model shows

 Adenine will always equal the amount of thymine and cytosine will always  equal guanine which fits with the Erwin Chargaff’s data

 Chargaff’s Rules

o Watson, Crick and Wilkins were awarded the Nobel prize but not Franklin because  she died of cancer

o Basic Structure of DNA:

 If looking down (looking at the top) on DNA, it is the same thickness  (uniform) We also discuss several other topics like In what year did the court in baird v eisenstadt) legalized birth control for all citizens of the u.s, irrespective of marital status?

 Figure 10.3 C, Page 187

 Figure 10.3 D, Page 187

Sections 10.4­10.5: DNA Replication

o DNA is copied every time a cell wants to replicate

o Very complicated/involves numerous steps

∙ Semiconservative Model of DNA Replication 

o In most DNA replication

o Whenever DNA is replicated (going from one strand to two), what doesn’t happen is  you have the old plus a new, it is that the new strands are made up of one old strand  and one new strand

o New DNA is made of one parent strand and one daughter strand making it  semiconservative 

o Half is new, half is old

 Figure 10.4 A, Page 188

∙ Replication in more detail

o There is multiple origins where DNA can be replicated 

o DNA unwinds and separates from each other to make space for the replication  o In each origin, the hydrogen bonds are broken and replication begins, creating  bubbles at the origin where the machinery can come in and start making new DNA o Goes in both directions until the bubbles are aligned and form the new strands of  DNA through merging Don't forget about the age old question of How foodborne illnesses occur?

 Figure 10.5 A, Page 189

o Reason it can occur in multiple directions is because they are anti­parallel  Running from 5’ to 3’ (how carbons are attached) 

 Other side is 3’ to 5’ 

 DNA replication can only happen in one direction 

 Figure 10.5 B, Page 189

∙ Enzymes involved in replication

o DNA Polymerase

 Adds nucleotides to the daughter strands

 Only adds nucleotides to the 3’ end (5’ to 3’ direction)

 Good at catching mistakes

 Proofreads: If a mistake is made, there is a period of time to fix it

∙ Ex: slows down mutation rates

o DNA Ligase

 Enzyme that takes short pieces of DNA and attaches them together

 Only important on one strand of the DNA 

 Figure 10.5 C, Page 189

 Okazaki fragments are made because the other strand is 3’ to 5’ so it builds a  short stretch, back up, build and DNA Ligase glues them together 

Sections 10.6­10.16: The flow of Genetic Information from DNA to RNA to Protein

∙ Central Dogma 

o DNARNAProteins (see in physical characteristics) 

o TranscriptionTranslation 

 Figure 10.6 A, Page 190

o All of this happens in the cytoplasm in prokaryotes

 Figure 10.7­1, Page 191 Don't forget about the age old question of What flower is significant in buddhism since that they grow out of muddy waters, representing detachment and purity?

∙ Genetic Code

o If you are going to translate something, you need to know what translates it in the  other language 

o How do we go from 4 nucleotides in DNA and RNA to 20 amino acids in proteins?  Genetic code=triplet code 

 Each 3 RNA nucleotides=1 amino acid 

∙ Also known as a codon=”words” 

∙ 64 possible codons => 20 amino acids

∙ Redundancy 

∙ Figure 10.8 A, Page 192

∙ AUG is the important “start” codon 

∙ Translation stops with UAA UAG and UGA

o Redundancy

 Explains the idea of 64 possible codons, but they only have 20 amino acids  More than one codon that can encode for the same amino acid

 UUU and UUC encode for phenylalanine 

o Unambiguous 

 If you have a single codon, there is no doubt to which it encodes for  No doubt as to which it codes for 

 Cannot ever encode for something else 

o Universal 

 Almost any organism, you can be confident 

 Figure 10.8 B, Page 192

o Without “punctuation” 

 Figure 10.8 B, Page 192

 Figure 10.3 D, Page 187

∙ Transcription 

o You’re starting with double stranded DNA

o DNA strands have to separate first

 Same with replication 

 Only one strand will be transcribed 

 U pairs with A in RNA

 Figure 10.9, Page 193

o RNA polymerase

o Promotor starts transcribing

 Tells RNA to combine and start transcribing

o Terminator stops transcribing 

 Causes the RNA to detach, which will stop transcription

o 3 stages:

 Same as translation but different things happen (don’t get confused)

 Initiation 

∙ RNA is going to recognize the promotor 

 Elongation 

∙ RNA starts building the new RNA

 Termination 

∙ RNA recognized terminator and it detaches and transcription will end  ∙ Figure 10.9, Page 193

∙ Transcription and Translation

o mRNA (messenger)

 actually going to be translated

 encodes amino acid sequences

o Location

 Prokaryotic­cytoplasm

∙ RNA Processing

o Happens with eukaryotes

o Several mechanisms

 Addition of cap and tail

 Purposes:

∙ Export from nucleus

∙ Prevent degradation

∙ Can help ribosomes bind

 Splicing

∙ Introns 

o Intervening sequences

o Areas that are going to be cut out before translation occurs

∙ Exons

o Expressed portions

o Remaining parts that will be translated

 Figure 10.10, Page 194

∙ Translation­tRNA

o Main player

o Transfer RNA

 Machinery that does the translating for us

o Interpreter for translation

o 2 part process:

 Recognize appropriate amino acid

 Recognize codon in RNA

 Figure 10.11 A, Page 195

 Figure 10.11 B, Page 195

∙ Through enzyme reactions

∙ Has to have ATP to attach amino acid

∙ Translation­Ribosomes

o Necessary for translation 

o Common for antibiotics

o Holds the mRNA and tRNA together 

 Catalyze the synthesis of polypeptide 

 Figure 10.12, Page 196

∙ Translation

o 3 phases:

 Initiation

∙ Brought together 

∙ Large and small subunits 

 Elongation

 Termination 

o Initiation 

 mRNA, tRNA with 1st amino acid

 ribosomal subunits are brought together

 Figure 10.13 A, Page 196

∙ Translation­Initiation 

o Determines where translation will begin

 Begins at start codon

 Typically AUG

o Occurs in 2 steps:

 mRNA binds to small ribosomal subunit

∙ first tRNA binds at the start codon

∙ Figure 10.13 B, Page 197

 large ribosomal subunit joins small subunit

∙ Translation­Elongation

o 3 steps:

 Codon recognition

 Peptide bond formation

 Translocation

∙ Movement 

∙ tRNA moves out and over to the P site

∙ growing polypeptide chain that moves

∙ Figure 10.14, Page 197

∙ Translation­Termination

o End of translation

o Stop codon reaches ribosome’s A site

 UAA, UAG, and UGA

 Does not code for amino acids

o Everything will fall apart

 Figure 10.15, Page 198

∙ Mutations

o Any time there is a change in the DNA sequence 

o Single base pairs

o Large regions of the chromosome 

 One letter in the DNA changes

o Mutagenesis occurs in 2 ways

 Spontaneous errors

 Exposure to mutagens 

∙ Can specifically cause damage to DNA

∙ Can be chemicals 

∙ Two Categories of Mutations

o Base substitutions­ number of DNA bases that do not change but a letter changes   Silent mutations

∙ Get a change in DNA sequence, but the polypeptide sequence does not change

 Missense mutations 

∙ The DNA sequence change and amino acid sequence changes


 Nonsense mutations

∙ DNA sequence changes but changes very specifically that will give 

you a stop codon

∙ Amino acid sequence translation 

∙ Stops rather than getting another amino acid 

o UGCUGA (stop codon)

o Deletions or insertions­ total number of nucleotides that can change (big problem)  After reading frame

 Usually causes significant changes

∙ Geno code is read in groups of 3 and only 3

∙ Location matters

 Figure 10.16 A, Page 199

 Figure 10.16 B, Page 199

Page Expired
It looks like your free minutes have expired! Lucky for you we have all the content you need, just sign up here