New User Special Price Expires in

Let's log you in.

Sign in with Facebook


Don't have a StudySoup account? Create one here!


Create a StudySoup account

Be part of our community, it's free to join!

Sign up with Facebook


Create your account
By creating an account you agree to StudySoup's terms and conditions and privacy policy

Already have a StudySoup account? Login here

BIO 111, Week 3 Notes

by: Phoebe Notetaker

BIO 111, Week 3 Notes BIOL 11100 - Fundamentals of Biology II

Phoebe Notetaker

Preview These Notes for FREE

Get a free preview of these Notes, just enter your email below.

Unlock Preview
Unlock Preview

Preview these materials now for free

Why put in your email? Get access to more of this material and other relevant free materials for your school

View Preview

About this Document

These are very detailed notes covering the material from week three of lecture.
Dr. Athena Anderson
Class Notes
Meiosis, Chromosomes, Chromatids
25 ?




Popular in Biology

Popular in Science

This 5 page Class Notes was uploaded by Phoebe Notetaker on Friday January 29, 2016. The Class Notes belongs to BIOL 11100 - Fundamentals of Biology II at Purdue University taught by Dr. Athena Anderson in Winter 2016. Since its upload, it has received 44 views. For similar materials see Biology in Science at Purdue University.

Similar to BIOL 11100 - Fundamentals of Biology II at Purdue


Reviews for BIO 111, Week 3 Notes


Report this Material


What is Karma?


Karma is the currency of StudySoup.

You can buy or earn more Karma at anytime and redeem it for class notes, study guides, flashcards, and more!

Date Created: 01/29/16
1/26/16  Genetics  Gregor Mendel: The Austrian/monk/biologist who figured out a large part of how genetics works with the  garden pea model.     Mendelian Genetics  ● Before Mendel, the idea about inheritance was not quantitative  ● Blending inheritance was the idea before Mendel’s work: offspring would have intermediate  characteristics compared to their parents.  ○ Ex: Child grows to a height that is in b/w the heights of his parents.  ○ The problem is that each generation would be more alike than the previous one,  eventually leading to a clone­like population.   ● Mendel showed the importance of quantifying experiments to discover the goings on of genetics.  ● He coined these terms:   ○ Genotype: Alleles carried by an individual/gene makeup.  ○ Phenotype: Physical appearance of the individual.  ○ Hybrid: Offspring of true­breeding parents w/ different traits for same character.  ○ Cross: Sexual reproduction b/w different individuals.  ○ Character: A feature, like hair color or plant height.  ○ Trait: The genotype or phenotype of an individual for a given character (red hair).  ● Familiarize yourself with meiosis to understand genetics.  ● Consider:  ○ What kinds of gametes can parents make?  ○ Sex = combining gametes from parents  ○ As chromosomes go, so go genes  ● Eventually we will be able to map genes and figure out where they are located on chromosomes.  ● True­breeding: Individuals always produce offspring that resemble themselves when  self­fertilized (only applies to plants).  ● Mendel crossed pea plants that were true­breeding for round seeds with pea plants that were  true­breeding for wrinkled seeds.  ● P0: Parental generation  ● F1: First filial/offspring generation  ● F2: Offspring of a cross b/w two F1 individuals  ● Wrinkled trait disappeared in the first generation.  ● Cross of F1 individuals will create a second generation of offspring. What does F2 look like?  ● Wrinkled reappears in the second generation.  ● Mendel counted many seeds and discovered:   ○ Proportions of ¾ round, ¼ wrinkled.  ○ Phenotypic ratio: 3 round: 1 wrinkled  ● Recessive trait: Masked by dominant trait; in this case, the wrinkled phenotype [r]  ● Dominant trait: Masks recessive traits; in this case, the round phenotype [R]  ● Offspring get one set of chromosomes from each parent­one allele for a character from each  parent.  ● What happens when you cross: RR x rr ?  ● The first parent can produce only gametes w/ ‘R’  ● The second parent can produce only gametes with ‘r’  ● F1 generation: all ‘Rr’  ● F2 generation: 3 round: 1 wrinkled phenotypic ratio  ● Law of Segregation: Two alleles for a heritable character separate from each other during gamete  formation, ending up in different gametes.  ● Genotype determines phenotype:   ○ RR dominant phenotype (homozygous)  ○ Rr dominant phenotype (heterozygous)  ○ rr recessive phenotype (homozygous)  ● Different genotypes can have the same phenotypes  ○ Ex: A yellow rose (phenotype) could be homozygous (YY) or heterozygous (Yy).  ● Punnett Squares are used to show possible genotypes and phenotypes of offspring  ● Gametic types are equally likely   ● They combine randomly and the outcome in each square is equally probable    ● Monohybrid cross: Only examining one trait in a cross  ○ Ex: Pea size or color but not both  ● Dihybrid cross: Examine two traits  ○ Ex: Pea size and color  ● Coss homozygous dominant for both w/ homozygous recessive for both: RRYY x rryy  ○ RRYY make only RY gametes  ○ rryy make only ry gametes  ●     RY  Ry  rY  ry  RY  RRYY  RRYy  RrYY  RrYy  Ry  RRYy  RRyy  RrYy  Rryy  rY  RrYY  RrYy  rrYY  rrYy  ry  RrYy  Rryy  rrYy  rryy    Law of Independent Assortment: Two or more genes are sorted into gametes independently of each other.   ● If independent assortment is occurring, laws of probability can be used, which allows us to  predict outcomes probabilistically.  ● Product Rule: The probability of two independent events occurring equals the product of  individual probabilities.  ● Many independently segregating loci exist  ○ Consider each individual probability and multiply individual probabilities.  ● Consider: AaBbCc x AaBbCc  ○ Probability of certain genotypes or phenotypes?  ○ To solve, consider each locus individually.  ○ The overall probability is the product of individual probabilities (events must be  independent)  ● Product Rule      1/28/16  ● Incomplete Dominance: Dominant allele doesn’t completely mask the recessive allele.  ● The degree of dominance is the result of biochemistry caused by gene expression.  ○ Ex: The plumage in chickens (blue, black, splash, white).  ● Black (bl) is wild type and recessive; blue is dominant (Bl) and inhibits eumelanin.  ○ Chickens bl/bl are black (no inhibition).  ○ Chickens Bl/Bl are splash (lots of inhibition).  ○ Chickens are blue (Bl/bl are blue (intermediate inhibition).  ● Codominance: Two alleles have equal contribution to offspring phenotype; when both traits from  the parents are expressed in the offspring.  ○ Heterozygotes have traits of both homozygous parents; offspring is red and blue  ○ Incomplete dominance in this example would make the offspring purple (blue + red).  ● An example of codominance in people is Sickle Cell Disease  ○ Sickle shaped red blood cells can’t c2​as well as normal red blood cells.  ○ SS genotype → All RBCs are sickle cells; severe health issues.  ○ AA genotype → No sickle cells.  ○ AS genotype → Normal and sickle cells.  ■ They carry the sickle allele, but they do not express the sickle cell disease.  ● 1/10 african americans have the AS genotype.  ● Why hasn’t this detrimental allele been eliminated via natural selection if it is so harmful to  humans?  ● It conferadaptive advantage on heterozygotes (AS) in areas with high malaria risk.  ● Heterozygotes have enough normal red blood cells to be relatively healthy, but not enough for  malarial parasite to take over their body and make them sick.  ● Multiple alleles: One gene controls a character, but has more than twoslide 8 . → ​ ○ Coat color in rabbits: C, c, ch, and h alleles.  ■ Four alleles influence coat color in rabbits.  ○ Human blood type: A, B, and O alleles.  ● Pleiotropy: One gene has multiple phenotypic effects.  ○ Ex: Frizzled chickens: One gene causes curled (defective) feathers, higher metabolism  and blood flow rates, and higher digestive capacity.  ○ Not so cute examples: Cystic fibrosis, Marfan syndrome  ● Epistasis: Phenotypic expression of one gene affects that of another gene at different locus (genes  can be bossy to each other).  ○ Ex: Horse coat color  ■ Extension gene codes for production of coat pigmentation (E [black] or e  [yellow/red­ish]).  ■ Agouti gene controls [where these genes are expressed] location of eumelanin  deposition on body (A or a).  ○ Coat color in horses:   ■ EE produces black/brown coat pigment eumelanin (cannot make phaeomelanin).  ■ ee produces chestnut coat pigment phaeomelanin (cannot make eumelanin).  ■ Ee is intermediate brown/red color (incomplete dominance).  ■ A_ produces eumelanin only on “points”  ■ aa produces uniform eumelanin deposition  ○ EEA_ produces a brown bay  ○ EeA_ produces a red bay  ■ [know phenotypes these genotypes produce for the exam]  ○ ee__ produces a chestnut/sorrel  ○ E_aa produces a black  ● Modifiers are genes that affect the degree to which another gene is expressed.  ○ Champagne gene is dominant and dilutes eumelanin and phaeomelanin.  ○ Cream gene dilutes red to yellow in heterozygotes.    ***No need to know the names of the horse colors, but you do need to know how the genes work!    ● Polygenic inheritance: Two or more genes affect the same phenotypic character (converse of  pleiotropy).  ○ Ex: Human skin color and eye color.    REVIEW (very likely to appear on the exam):  Be able to distinguish these and know examples:  1. Dominance: dominant allele prevents expression of recessive allele in offspring  2. Codominance: both alleles expressed equally in offspring  3. Incomplete dominance: offspring have intermediate traits  4. Multiple alleles: one gene has more than 2 alleles  5. Pleiotropy: one gene has many phenotypic effects  6. Epistasis: one gene masks the expression of another  7. Polygenic inheritance: more than one gene affects phenotype of one character (Human eye and skin  color).    Non­Mendelian Genetics  ● Examples in which the genes do not behave the way that Mendel described: Sex­linked genes,  linkage, abnormal chromosome numbers.  ● Sex­linked genes: Genes located on sex chromosomes.  ○ Y­linked genes are generally harmless, because the Y chromosome is so tiny that it  doesn’t cause many problems.  ○ X­linked genes are responsible for several conditions:  ■ Color blindness in men: Cannot distinguish red from green.  ■ Duchenne muscular dystrophy in men: Progressive weakness in muscles.  ■ Hemophilia: Decreases blood’s ability to clot, risk of bleeding to death.  ● Some cat coat colors are the result of x­linked genes  ○ The genes for orange and black coat color are both on the X chromosome  ○ Males (Xy) express the color that’s on their one X  ○ Females (XX) express both colors, causing tortoiseshell and calico patterns if black and  orange.  ○ ONLY males w/ XXy genotype can be tortoiseshell or calico.  ● Linkage: Autosomal genes are frequently inherited together during meiosis if their loci are in  close proximity.  ○ As distance b/w genes increases, the more likely recombination increases.  ● Abnormal chromosome numbers: Nondisjunction during meiosis results in gametes that are  diploid for some genes.  ● Polyploid: Individual has more than diploid chromosome sets; many commercial fruits are  polyploid.     ● Pedigree analysis: Graphical method that summarizes family data.  ○ Suggests models of inheritance for diseases  ○ Can be used for genetic mapping  ○ Ex: A pedigree could be used to determine whether a couple is at high risk for passing on  a genetic disorder to a child    Human Genome Project  ● Initiated in 1990   ● Existing genetic and physical maps were used as foundation  ● In 2001 partial maps were reported w/ ~25,000 genes  ● Gaps are currently still being filled in  ● New techniques are now being used to fill gaps: Identifying single nucleotide differences   


Buy Material

Are you sure you want to buy this material for

25 Karma

Buy Material

BOOM! Enjoy Your Free Notes!

We've added these Notes to your profile, click here to view them now.


You're already Subscribed!

Looks like you've already subscribed to StudySoup, you won't need to purchase another subscription to get this material. To access this material simply click 'View Full Document'

Why people love StudySoup

Steve Martinelli UC Los Angeles

"There's no way I would have passed my Organic Chemistry class this semester without the notes and study guides I got from StudySoup."

Anthony Lee UC Santa Barbara

"I bought an awesome study guide, which helped me get an A in my Math 34B class this quarter!"

Bentley McCaw University of Florida

"I was shooting for a perfect 4.0 GPA this semester. Having StudySoup as a study aid was critical to helping me achieve my goal...and I nailed it!"

Parker Thompson 500 Startups

"It's a great way for students to improve their educational experience and it seemed like a product that everybody wants, so all the people participating are winning."

Become an Elite Notetaker and start selling your notes online!

Refund Policy


All subscriptions to StudySoup are paid in full at the time of subscribing. To change your credit card information or to cancel your subscription, go to "Edit Settings". All credit card information will be available there. If you should decide to cancel your subscription, it will continue to be valid until the next payment period, as all payments for the current period were made in advance. For special circumstances, please email


StudySoup has more than 1 million course-specific study resources to help students study smarter. If you’re having trouble finding what you’re looking for, our customer support team can help you find what you need! Feel free to contact them here:

Recurring Subscriptions: If you have canceled your recurring subscription on the day of renewal and have not downloaded any documents, you may request a refund by submitting an email to

Satisfaction Guarantee: If you’re not satisfied with your subscription, you can contact us for further help. Contact must be made within 3 business days of your subscription purchase and your refund request will be subject for review.

Please Note: Refunds can never be provided more than 30 days after the initial purchase date regardless of your activity on the site.