New User Special Price Expires in

Let's log you in.

Sign in with Facebook


Don't have a StudySoup account? Create one here!


Create a StudySoup account

Be part of our community, it's free to join!

Sign up with Facebook


Create your account
By creating an account you agree to StudySoup's terms and conditions and privacy policy

Already have a StudySoup account? Login here

Human Phys. Notes for Week of February 1st - 5th (M & W Lectures)

by: Cristina Villagran-Gonzalez

Human Phys. Notes for Week of February 1st - 5th (M & W Lectures) Biology 207

Marketplace > California State University Long Beach > Biology > Biology 207 > Human Phys Notes for Week of February 1st 5th M W Lectures
Cristina Villagran-Gonzalez
Long Beach State
GPA 4.0
View Full Document for 0 Karma

View Full Document


Unlock These Notes for FREE

Enter your email below and we will instantly email you these Notes for Human Physiology

(Limited time offer)

Unlock Notes

Already have a StudySoup account? Login here

Unlock FREE Class Notes

Enter your email below to receive Human Physiology notes

Everyone needs better class notes. Enter your email and we will send you notes for this class for free.

Unlock FREE notes

About this Document

These notes cover the very last portion of chapter 2 (proteins) as well as all of chapter 4 (Enzymes & Energy) and the beginning of chapter 3 (Cell Structure & Function).
Human Physiology
Dr. Balwant Khatra
Class Notes
Biology, Human Physiology, cells, Enzymes, Proteins




Popular in Human Physiology

Popular in Biology

This 6 page Class Notes was uploaded by Cristina Villagran-Gonzalez on Tuesday February 2, 2016. The Class Notes belongs to Biology 207 at California State University Long Beach taught by Dr. Balwant Khatra in Spring 2016. Since its upload, it has received 35 views. For similar materials see Human Physiology in Biology at California State University Long Beach.


Reviews for Human Phys. Notes for Week of February 1st - 5th (M & W Lectures)


Report this Material


What is Karma?


Karma is the currency of StudySoup.

You can buy or earn more Karma at anytime and redeem it for class notes, study guides, flashcards, and more!

Date Created: 02/02/16
Lecture – 2/1 Proteins  Most important macromolecule – proteins have a large variety of functions in our body (almost  limitless amount of functions)  Each protein has a unique 3D structure – determined by DNA  Structure: acid group + amino group + functional group, which varies among proteins  Proteins are made by dehydration synthesis  H is stripped from amino end and OH is stripped  from carboxyl end  o Forms a peptide bond (bond btwn the amino acids)  Covalent bond – very strong, not easily broken  Backbone is made up of Nitrogen – Carbon – Carbon bonds  Backbone produces 3D shape – R groups are hanging out  2 terminals – amino terminal & carboxyl terminal  Have certain areas for molecules to bind onto  4 levels of Protein Structure o Primary structure = sequence of amino acids (Polypeptide strand) o Secondary Structure = caused by weak H bonding of adjacent polypeptide bonds  Results in alpha helix or beta pleated sheet structure due to these hydrogen bonds  Due to backbone of protein ­ determined by the interactions of the R groups  which can bond with each other o Tertiary Structure = the specific 3D shape of the protein which is very important to its  function  Forming of polypeptide  Differ among amino acids due to varying structures  Folding & bending of the amino acid chains ­ There are hydrophobic bonds, ionic bonds, & covalent bonds present   Since it is held together by weak bonds, proteins can easily become  denatured by changes in pH or temperature o Quaternary structure = multiple polypeptide chains covalently bonded to each other  Polypeptides are attracted to each other due to hydrogen, ionic, hydrophobic and  sulfide bonds   Conjugated Proteins – ex: glycoproteins, lipoproteins  Protein functions: structural, enzymes, antibodies, receptors, carriers Chapter 4 – Enzymes & Energy “All enzymes are proteins, but not all proteins are enzymes” Enzymes  Serve as catalysts – speed up rate of reaction, but remain unchanged at end of reaction o Do not change nature of reaction o Increase rxn by lowering activation energy  Most of them are proteins A + B   C + D Reactants (substrates) Products  Ways to increase energy for activation: heat, pH o However, heat has negative effect on cells – enzymes allow rxns to occur at lower temps  Enzymes increase proportion of molecules that have enough energy to react Mechanisms  Function of enzyme dictated by structure  Enzymes have a specific 3D structure w/ pockets where substrate can bind to enzyme (called  active site or catalytic center)  Lock and key fit  form enzyme – substrate complex  Enzymes can only accommodate one type of substrate – Very specific  Enzymes allow for new bonds to form between substrate Naming  Name based on enzyme function o Usually end in ­ase o Can also contain name of substrate and activity Isoenzymes  Enzymes that do the same job in two different organs o Have the same o Molecules may be slightly different Control of Enzyme Activity  Enzyme activity measured by rate at which substrate is converted to product o Influenced by pH, temp, concentration of cofactors, conc. Of enzyme & substrate,  possible stimulatory or inhibitory effects of products on enzyme function  Must be in optimal range (pH & temp) for maximal activity of enzyme – 3D  structure is affected when outside of this range  Ex: pepsin has optimal pH of 2 bc it works in our stomach which  produces hydrochloric acid  Depends on environment of the cell o Coenzymes – additional small molecules which aid the enzyme activity  Transport hydrogen atoms and other small molecules btwn enzymes  Organic molecules derive from water­soluble vitamins o Cofactors – metal ions  Help from active site through conformational change of the enzyme or help in  enzyme – substrate binding o Substrate Concentration  Rate of product formation increases as substrate conc increases  Continues until rxn reaches a plateau – at this point, enzyme is said to be  saturated (reaches its maximum rate)  Some enzymes produced in an inactive form and activated when they are needed (ex: pepsinogen   pepsin)  Some enzymes are activated by other enzymes through phosphorylation or dephosphorylation  Activity can be controlled by turnover – degrading enzymes  Sometimes, single enzymes can have a reversible rxn  o Depends on substrate/product concentration o Called Law of Mass Action Metabolic Pathways  Series of rxns linked together which convert an initial substrate into a product  Most metabolic pathways are branched – they can produce several products o Product of one enzyme rxn becomes substrate for the next  Each step is an intermediate & catalyzed by different enzymes  Regulation o End Product Inhibition: occurs when 1 product in a divergent pathway inhibits activity of  the branch ­point enzyme  Prevents final product accumulation; causes rxn to favor alternate pathway  Occurs by allosteric inhibition – product binds to enzyme causing it to change to  an inactive shape   Prevents earlier rxns from occurring o Inborn Errors of Metabolism: due to inherited defects in genes for enzymes in metabolic  pathways  Metabolic disease can occur from:  Increases in intermediates formed prior to the defective enzyme  Decreases in products normally formed after defective enzyme   All intermediates before error will accumulate product Bioenergetics  Deals with transfer of energy  Energy comes in many different forms (light, chemical, electrical, etc) o Can be transferred from one form to another form, but cannot be created o Follows laws of thermodynamics  1  law of thermodynamics: energy cannot be created nor destroyed, only transformed o Conversion of light energy to glucose (plants) nd  2  law of thermodynamics: energy is lost with each transformation as heat, so available  organized energy (free energy) decreases o Entropy = degree of disorganization  Increases at each step of energy transformation o Relates to endergonic & exergonic rxns  Endergonic: chemical rxn which requires input of energy Lecture 2/3 Chapter 3 – Cell Structure & Genetic Control Cells  Smallest unit in our bodies that provide functions  Large variety; Common features o Plasma membrane & associated proteins  Cells in diff tissues have different proteins   All cells surrounded by membrane – has various functions including aid in  communication, acting as a barrier, etc – must know composition of membrane o Cytoplasm & organelles  Fluid within cell; contains organelles inside it – will need to know functions of  different organelles o Nucleus (not all cells have them)  Surrounded by membrane; contains all genetic material Plasma Membrane   Structure of phospholipid plays a role in structure of membrane o Hydrophobic parts (fatty acid tails) vs hydrophilic parts (phosphate head)  Membrane made up of two layers of phospholipids – phospholipid bilayer o Tails are in middle, heads are both outside the cell and inside the cell (outside layer of  membrane) o Primarily hydrophobic – which is why membranes are selectively permeable  Small hydrophobic molecules can pass through easily o Cholesterol molecules embedded within membrane – to fill in holes  o Not a rigid structure – phospholipids are essentially fluid  fluid mosaic model  Proteins do not have a set pattern (not stationary) – moving all the time o Peripheral proteins embedded in membrane, but portion is sticking out or in o Integral proteins are both inside and sticking outside membrane  Membrane Proteins o Integral proteins span membrane o Peripheral proteins embedded on just one side of the membrane  Functions: Structural support, transport, enzymatic control of cell processes,  receptors for hormones & other molecules (molecule that can identify signal and  respond appropriately), “self” markers for immune system  Also have carbs (glycoproteins & glycolipids) on part of outer surface which help mark the cell – impart negative charge  Cilia: small extension from surface of the cell – tiny hair like structures composed of  microtubules that project from plasma membrane o Help cell move (motile cilia) through hollow organs o Primary cilium may have a sensory function – found on almost every cell in body o Covered by plasma membrane  Flagella: single whip like structure that propels a cell to move forward o Sperm  Microvilli: folds in PM that increase surface area for rapid diffusion  Transport o Bulk transport: a way cells move large molecules and particles across PM  Exocytosis vs endocytosis  Whole membrane of cell participates in these types of transport  3 types of endocytosis  Phagocytosis: cell eating – membrane surrounds material to take into cell using a vacuum  o Pseudopods are formed  Pinocytosis: cell drinking – bringing dissolved material into the cell –  mostly fluid accumulates o nonspecific  Receptor­mediated Endocytosis: receptors used to bring specific material into cell – material binds to these receptors then forms indentation to  bring them in  Exocytosis: large cellular products are moved out of cell  Golgi apparatus packages proteins into vesicles that fuse with plasma  membrane Cytoplasm & Organelles  Material within a cell o Includes organelles, fluid (cytosol), microtubules & microfilaments (long structure made  by combing proteins together) & intermediate filaments called cytoskeleton o Cytoskeletal proteins  Extremely dynamic  Continuously made and dissolved  Localize different organelles in different parts of cytoplasm  Help in transporting molecules from one side of cell to another (act as highways)  Form spindle apparatus that pulls chromosomes apart in mitosis  Lysosomes o Organelles filled w. digestive enzymes – digestive system of cell  Digest any material which is not needed by the cell o Fuse w/ food vacuoles after an immune cell engulfs a bacterium or dead cell o Primary lysosome: only contains digestive enzymes o Secondary Lysosome: contains partially digested contents of food vacuole o Residual Lysosome: lysosome filled with waste which can leave cell through exocytosis  or recycled o Carry out apoptosis – death of a cell & autophagy   Peroxisome o Vesicle like organelles (similar to lysosomes) which contains oxidative enzymes which  are involved in detoxification in liver & lipid breakdown  Ex: detoxification of alcohol  Mitochondria o Powerhouse of the cell o Where all energy is produced o Have inner & outer membrane separated by intermembrane space  Inner membrane is folded into cristae o Believed to have originated from symbiotic bacteria o Inside of mito: matrix – contains all enzymes responsible for breaking down nutrients o Have their own DNA ­ comes from mother  Ribosomes o Protein factories of the cell  mRNA takes genetic info to ribosome so protein can be assembled o very small – found free in cytoplasm, but most are attached to rough E.R  broken into 2 subunits composed of proteins & ribosomal RNA while not in use  Endoplasmic Reticulum o System of membranes specialized for synthesis or degradation of molecules o Rough  Contains ribosomes  Main function: protein synthesis & protein modification o Smooth  Contains enzymes for synthesis of lipids such as steroids; Ca  storage &  detoxification  No ribosomes attached  Golgi Apparatus (Complex) o Consists of stacks of flattened sacs  One side receives proteins from ER   Modifies them & sorts them – then packaged in vesicles & bud off to fuse with  the plasma membrane for exocytosis Nucleus  Most cells have one nucleus o Muscle cells have hundreds; RBC’s have none  Enclosed by nuclear envelope made of 2 membranes o Outer membrane: continuous w/ rough ER o Inner membrane: often fused with outer membrane o Nuclear pores: allow material to go in and out of nucleus – allow small molecules to  diffuse through them  Nucleolus contained in center of nucleus o Important for making ribosomes DNA & Genes  Nucleus contains chromosomes which are made up of genes – small part of chromosome that  codes for a specific protein o Gene on DNA is transcribed as mRNA, which can leave the cell o mRNA then translated at ribosome to assemble proper amino acid sequence  these two steps = Genetic Expression  Genome & proteome o Genome: all the genes in a particular individual or all the genes of a particular species  Humans: ~25000 genes o Proteome is all the proteins produced from the genome  More than 150000 proteins produced in the human body  Chromatin o DNA in nucleus packaged w/ proteins called histones – form chromatin  Euchromatin: active in transcription, looser. Changes in histones allow molecule  access to DNA during gene expression  Heterochromatin: inactive regions


Buy Material

Are you sure you want to buy this material for

0 Karma

Buy Material

BOOM! Enjoy Your Free Notes!

We've added these Notes to your profile, click here to view them now.


You're already Subscribed!

Looks like you've already subscribed to StudySoup, you won't need to purchase another subscription to get this material. To access this material simply click 'View Full Document'

Why people love StudySoup

Steve Martinelli UC Los Angeles

"There's no way I would have passed my Organic Chemistry class this semester without the notes and study guides I got from StudySoup."

Allison Fischer University of Alabama

"I signed up to be an Elite Notetaker with 2 of my sorority sisters this semester. We just posted our notes weekly and were each making over $600 per month. I LOVE StudySoup!"

Jim McGreen Ohio University

"Knowing I can count on the Elite Notetaker in my class allows me to focus on what the professor is saying instead of just scribbling notes the whole time and falling behind."


"Their 'Elite Notetakers' are making over $1,200/month in sales by creating high quality content that helps their classmates in a time of need."

Become an Elite Notetaker and start selling your notes online!

Refund Policy


All subscriptions to StudySoup are paid in full at the time of subscribing. To change your credit card information or to cancel your subscription, go to "Edit Settings". All credit card information will be available there. If you should decide to cancel your subscription, it will continue to be valid until the next payment period, as all payments for the current period were made in advance. For special circumstances, please email


StudySoup has more than 1 million course-specific study resources to help students study smarter. If you’re having trouble finding what you’re looking for, our customer support team can help you find what you need! Feel free to contact them here:

Recurring Subscriptions: If you have canceled your recurring subscription on the day of renewal and have not downloaded any documents, you may request a refund by submitting an email to

Satisfaction Guarantee: If you’re not satisfied with your subscription, you can contact us for further help. Contact must be made within 3 business days of your subscription purchase and your refund request will be subject for review.

Please Note: Refunds can never be provided more than 30 days after the initial purchase date regardless of your activity on the site.